@第{条IJNAM-12-286，作者={}，title={求解离子溶剂中生物分子的尺寸修正泊松-玻耳兹曼方程的有效最小化协议}，journal={国际数值分析与建模杂志}，年份={2015年}，体积={12}，数字={2}，页数={286--301}，摘要={发展了尺寸修正的泊松-玻耳兹曼方程（SMPBE），以考虑静电势能计算中的离子尺寸效应及其数值解对于生物分子来说，仍然是一个具有挑战性的研究课题。为了应对这一挑战，在本文中，我们提出了一个解分解公式，然后开发了一个有效的最小化协议用有限元近似技术求解非线性SMPBE模型。作为作为一个应用程序，特殊的SMPBE数值算法被构造并编程为生物分子（如蛋白质和DNA）的有限元程序包，对称1:1离子溶剂。我们还构建了一个具有解析解的非线性SMPBE球模型将其用于验证我们的新SMPBE数值算法和程序包。此外，在中心带电球模型上进行了数值实验，以显示一些物理特征由SMPBE模型捕获。最后，它们是由六个不同网络的生物分子组成的演示SMPBE有限元程序包的计算机性能。数值结果表明，SMPBE模型可以捕捉离子的某些物理性质与经典的PBE模型相比，溶剂更合理，求解效率更高。作为应用SMPBE模型，计算了自由溶剂化能，并与PBE模型的案例。
},issn={2617-8710}，doi={https://doi.org/},url={http://global-sci.org/intro/article_detail/ijnam/489.html}}
TY-JOUR公司T1-求解离子溶剂中生物分子尺寸修正泊松-玻耳兹曼方程的有效最小化协议JO-国际数值分析与建模杂志VL-2级SP-286EP-3012015年上半年DA-2015/12年序号-12做-http://doi.org/UR-（欧元）https://global-sci.org/intro/article_detail/ijnam/489.htmlKW-Poisson-Boltzmann方程，变分最小化，有限元法，隐式溶剂，静电势。AB公司-发展了尺寸修正的泊松-玻耳兹曼方程（SMPBE），以考虑静电势能计算中的离子尺寸效应及其数值解对于生物分子来说，仍然是一个具有挑战性的研究课题。为了应对这一挑战，在本文中，我们提出了一个解分解公式，然后开发了一个有效的最小化协议用有限元近似技术求解非线性SMPBE模型。作为作为一个应用程序，特殊的SMPBE数值算法被构造并编程为对称1:1生物分子（如蛋白质和DNA）的有限元程序包离子溶剂。我们还构建了一个具有解析解的非线性SMPBE球模型将其用于验证我们的新SMPBE数值算法和程序包。此外，在中心带电球模型上进行了数值实验，以显示一些物理特征由SMPBE模型捕获。最后，它们是由六个不同网络的生物分子组成的收费来演示我们的SMPBE有限元程序包的计算机性能。数值结果表明，SMPBE模型可以捕捉离子的一些物理性质与经典的PBE模型相比，溶剂更合理，求解效率更高。作为应用SMPBE模型，计算了自由溶剂化能，并与PBE模型的案例。
Jiao Li和Dexuan Xie。(1970). 用于求解离子溶剂中生物分子的尺寸修正泊松-玻耳兹曼方程的有效最小化协议。国际数值分析与建模杂志.12(2).286-301.数字对象标识：
复制到剪贴板
