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单细胞实验

单单元数据的S4类


生物导体版本:释放(3.19)

定义用于存储单细胞实验数据的S4类。这包括存储和检索尖峰信息的专门方法、每个细胞的维度缩减坐标和大小因子,以及基因和库的常用元数据。

作者:亚伦·伦[aut,cph],大卫·里索[aut(,拉扎皮)

维护人员:Davide Risso<gmail.com上的Risso.Davide>

引文(从R中输入引文(“单细胞实验”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“单细胞实验”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“单细胞实验”)
1.SingleCellExperiment课程简介 HTML格式 R脚本
2.在SingleCellExperiment对象上应用 HTML格式 R脚本
3.围绕单细胞实验课发展 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 数据导入,数据表示,免疫肿瘤学,基础设施,单个单元格,软件
版本 1.26.0
在生物导体中 生物技术3.6(R-3.4)(6.5年)
许可证 GPL-3型
取决于 总结性实验
进口 方法、utils、stats、,S4载体,生物遗传学,基因组范围,延迟阵列
系统要求
统一资源定位地址
查看更多
建议 测试那个,仿生风格,针织物,rmarkdown公司,矩阵,scRNA序列(>= 2.9.1),Rtsne公司
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取决于我 BASiCS公司,贝叶斯空间,催化剂,契塔,牢房工作台,CellTrails公司,赛利德,DropletUtils公司,实验子集,织机实验,桅杆,NeuCA公司,POWSC公司,SiPSiC公司,单细胞通道实验,空间实验,TENxIO公司,TSCAN公司,轨迹实用程序,树总结实验,雪花石膏.sce,批处理器,塞尔达,集群实验,锡达尔,细胞描记器,解复用SNP,梦想家,表雄激素额外,表调节子,iSEE公司,iSEEhub公司,iSEE索引,琵琶,米娅,蒙莫萨,sc注释器,scDblFinder,scGPS,sc管道,散射,白蜡,尖叫声,舷窗,scviR公司,simPIC公司,单细胞TK,飞溅,开关,tidy单细胞实验,三轮车,锌波,HCA数据,imc数据集,鼠标老化数据,鼠标胃部数据,鼠标胸腺老化,muscData(蘑菇数据),scATAC。资源管理器,scMultiome公司,scRNA序列,S示例数据,TENxBrain数据,TENxPBMC数据,TM浏览器,WeberDivechaLC数据、OSCA简介、,DIscBIO公司,imc实验,核糖核酸酶R
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程序包档案

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源程序包 单细胞实验_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 单细胞实验_1.26.0.zip
macOS二进制(x86_64) 单细胞实验_1.26.0.tgz
macOS二进制(arm64) 单细胞实验_1.26.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SingleCell实验
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/单细胞实验
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/SingleCell实验/
包短Url https://bioconductor.org/packages/SingleCell实验/
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