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百万卢比

图的微分邻域丰度检验


生物导体版本:释放(3.18)

Milo执行单细胞差异丰度测试。细胞状态被建模为最近邻图上的代表性邻域。假设检验是使用一个负生物学广义线性模型进行的。

作者:迈克·摩根(aut,cre),艾玛·丹恩(Emma Dann)

维护人员:迈克·摩根<michael.Morgan at abdn.ac.uk>

引文(从R中输入引文(“miloR”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“miloR”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“miloR”)
用Milo进行差异丰度测试 HTML格式 R脚本
米洛小鼠原肠胚形成的差异丰度测试 HTML格式 R脚本
使用对比度进行差异丰度测试 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 功能基因组学,多重比较,单个单元格,软件
版本 1.10.0
在生物导体中 生物化学3.13(R-4.1)(3年)
许可证 GPL-3+文件许可证
取决于 R(>=4.0.0),边缘R
进口 生物邻居,生物遗传学,单细胞实验,矩阵(>=1.3-0),S4载体、stats、stringr、methods、igraph、irlba、cowplot、,生物并行,BiocSingular公司,利马,ggplot2,tible,矩阵统计,ggraph,gtools,总结性实验、拼凑、tidyr、dplyr、ggreset、ggbeeswarm、RColorBrewer、grDevices
系统要求
统一资源定位地址 https://marionilab.github.io/miloR网址
错误报告 https://github.com/MarioniLab/miloR/issues
查看更多
建议 测试,MASS,mvtnorm,散射,尖叫声covr、knitr、rmarkdown、uwot,舷窗,仿生风格,鼠标胃部数据,鼠标胸腺老化、魔法、RCurl、卷曲、图形
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 百万卢比_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 miloR_1.10.0.zip(百万卢比)(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 百万卢比_1.10.0.tgz
macOS二进制(arm64) 百万卢比_1.10.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miloR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包装/miloR
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/miloR网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/miloR/
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