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补充条款3

单细胞共识聚类


生物导体版本:释放(3.18)

用于单细胞RNA-Seq数据的无监督聚类和分析的工具。

作者:弗拉基米尔·基塞列夫

维护人员:弗拉基米尔·基斯列夫(Vladimir Kiselev)<Vladimir.yu.Kiselev at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“SC3”))以下为:

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“SC3”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“SC3”)
SC3包装手册 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 分类,群集,数据表示,微分表达式,尺寸缩减,图形用户界面,免疫肿瘤学,RNA序列,单个单元格,软件,支持向量机,转录,转录组学,可视化
版本 1.30.0
在生物导体中 生物多样性3.3(R-3.3)(8年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=3.3)
进口 graphics、stats、utils、methods、e1071、parallel、foreach、doParallel、doRNG、shirn、ggplot2、pheatmap(>=1.0.8)、ROCR、robustbase、rrcov、cluster、WriteXLS、Rcpp(>=0.11.1)、,总结性实验,单细胞实验,生物遗传学,S4矢量
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/hemberg-lab/SC3
错误报告 https://support.bioconductor.org/t/sc3支持/
查看更多
建议 knitr、rmarkdown、mclust、,散射,仿生风格
链接到 Rcpp、RcppArmadillo
增强功能
取决于我
导入我 美食
建议我 交互式复杂热图,scTreeViz软件,增值税出口
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 SC3_1.30.0.tar.gz
Windows二进制 SC3_1.30.0.zip码
macOS二进制(x86_64) SC3_1.30.0.tgz
macOS二进制(arm64) SC3_1.30.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SC3
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/SC3
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/SC3/
包短Url https://bioconductor.org/packages/SC3/
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