zellkonverter公司

scRNA-seq对象之间的转换

生物导体版本：释放（3.18）

提供在Python AnnData对象和SingleCellExperiment对象之间进行转换的方法。这些主要用于封装Python方法的下游Bioconductor包，用于单细胞数据分析。它还包括读取和写入用于将AnnData对象保存到磁盘的H5AD文件的功能。

作者：卢克·扎皮亚[aut，cre]，亚伦·伦[aut]，杰克·卡姆罗布勒希·坎努特(，rcannood）

维护人员：卢克·扎皮亚（Luke Zappia）

引文（从R中输入引文（“zellkonverter”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“zellkonverter”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览Vignette（“zellconverter”）

将AnnData转换为SingleCellExperimentas	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本
许可证	文本

生物视图	数据导入,数据表示,单个单元格,软件
版本	1.12.1
在生物导体中	生物柴油3.12（R-4.0）（3.5年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于
进口	矩阵，蛇怪、网状、，单细胞实验(>= 1.11.6),总结性实验,DelayedArray（延迟阵列）、方法、，S4载体，实用程序，cli
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/theislab/zellkonverter网站
错误报告	https://github.com/theislab/zellkonverter/issues

建议	安达塔，生物文件缓存,仿生风格，盖，HDF5阵列、knitr、pkgload、rmarkdown、，rhdf5型(>= 2.45.1),scRNA序列、拼写、测试、withr
链接到
增强功能
取决于我	OSCA简介
导入我	单细胞TK,速度捕捉器
建议我	单元格生成dp,CuratedAtlasQueryR,全球视野,HCA onsilData公司,HDF5阵列
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	zellkonverter_1.12.1.tar.gz公司
Windows二进制	zellkonverter_1.12.1.zip文件（仅64位）
macOS二进制（x86_64）	zellkonverter_1.12.1.tgz型
macOS二进制（arm64）
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/zellkonverter网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：packages/zellkonverter
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/zellkonverter网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/zellkonverter网站/
软件包下载报告	下载统计信息
BioC 3.18的旧源程序包	源存档