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现象疗法

具有异质遗传和环境背景的基因组轨迹


生物导体版本:发布(3.18)

PhenoPath在存在异质遗传和环境背景的情况下推断基因组轨迹(伪时间),并测试它们之间的相互作用。

作者:基兰·坎贝尔

维护人员:基兰·坎贝尔(Kieran Campbell)

引文(从R中输入引文(“现象疗法”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“现象路径”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“现象疗法”)
渐晕图标题 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式

细节

生物视图 贝叶斯主义者,基因表达式,免疫肿瘤学,主要组件,RNA序列,单个单元格,软件
版本 1.26.0
在生物导体中 生物技术3.6(R-3.4)(6.5年)
许可证 Apache许可证(==2.0)
取决于
进口 Rcpp(>=0.12.8),总结性实验,方法,统计,dplyr,tibble,ggplot2,tidyr
系统要求
统一资源定位地址
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建议 knitr、rmarkdown、forcats、test、,生物风格,单细胞实验
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 现象路径_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 表型_1.26.0.zip
macOS二进制(x86_64) 现象路径_1.26.0.tgz
macOS二进制(arm64) 现象路径_1.26.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/phenopath
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/现象疗法
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/phenopath网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/phenopath/
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