CoGAPS公司
模式集中的协调基因活性
生物导体版本：释放（3.18）
模式集中的协调基因活性（CoGAPS）实现了贝叶斯MCMC矩阵分解算法GAPS，并将其与基因集统计方法联系起来推断生物过程活性。它可以用于对任何数据进行稀疏矩阵分解，当这些数据代表生物分子时，可以进行基因集分析。
作者：珍妮特·约翰逊（Jeanette Johnson）、阿什利·曾荫权（Ashley Tsang）、雅各布·米切尔（Jacob Mitchell）、托马斯·谢尔曼（Thomas Sherman）、李伟兴（Wai shing Lee）、康诺·凯尔顿（Conor Kelton）、昂德雷·马克西安（Ondrej Maxian）、雅克·凯里（Jacobe Carey Carey）、杰纳维夫·斯坦·布里恩（Genevieve Stein-O’Brien）
维护人员：Elana J.Fertig<ejfertig at jhmi.edu>，Thomas D.Sherman<tomsherman159 at gmail.com>，Jeanette Johnson<jjohn450 at jhmi.edu>，Dmitrijs Lvovs<dlvovs1 at jh.edu>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“CoGAPS”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
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细节
| 生物视图 |
贝叶斯主义者,群集,差异表达式,尺寸缩减,基因表达,GeneSet扩展,免疫肿瘤学,微阵列,多重比较,RNA序列,软件,时间课程,转录 |
| 版本 |
3.22.0 |
| 在生物导体中 |
生物碳2.7（R-2.12）（13.5年） |
| 许可证 |
BSD_3_clause+文件许可证 |
| 取决于 |
R（>=3.5.0） |
| 进口 |
生物并行，集群，方法，gplot，图形，grDevices，RColorBrewer，Rcpp，S4载体,单细胞实验，统计，总结性实验、工具、实用程序，rhdf5型,生物反应器、dplyr、，fgsea公司，用于猫，ggplot2，msigdbr |
| 系统要求 |
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| 统一资源定位地址 |
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程序包档案
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