赛利德

基于多重对应分析的单细胞基因特征无偏提取

生物导体版本：释放（3.18）

CelliD是一种无聚类的多元统计方法，用于从单细胞RNA-seq稳健提取per-cell基因特征。CelliD允许跨不同供体、原生质组织、模型生物和单细胞组学协议进行无偏见的细胞身份识别。该软件包还可用于探索单细胞数据中的功能途径富集。

作者：阿基拉·科尔塔尔[aut，cre]，安东尼奥·劳塞尔[aut、ctb]

维护人员：Akira Cortal<Akira.Cortal at institutregine.org

引文（从R中输入引文（“CelliD”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：

if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“CelliD”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“CelliD”）

生物视图	ATACSeq公司,群集,尺寸缩减,基因表达式,GeneSet扩展,RNA序列,单个单元格,软件
版本	1.10.1
在生物导体中	生物化学3.13（R-4.1）（3年）
许可证	GPL-3+文件许可证
取决于	R（>=4.1），修拉（>=4.0.1），单细胞实验
进口	Rcpp、RcppArmadillo、stats、utils、Matrix、tictoc、，散射、stringr、irlba、data.table、glue、pbapply、umap、Rtsne、reticulate、fastmatch、matrixStats、ggplot2、，生物并行,总结性实验,fgsea公司
系统要求
统一资源定位地址

建议	针织者，rmarkdown，仿生风格测试，tidyverse，ggpubr，命运，gg排斥
链接到	Rcpp、RcppArmadillo
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	CelliD_1.10.1.tar.gz公司
Windows二进制	CelliD_1.10.1.zip手机
macOS二进制（x86_64）	赛尔iD_1.10.1.tgz
macOS二进制（arm64）	赛尔iD_1.10.1.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CelliD
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/CelliD
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/CelliD网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/CelliD网站/
软件包下载报告	下载统计信息
BioC 3.18的旧源程序包	源存档