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锡达尔

使用质量细胞术进行差异丰度分析


生物导体版本:释放(3.18)

在大规模细胞术数据中确定样本和组之间差异丰富的人群。提供将细胞计数为超球体、控制空间错误发现率以及可视化高维标记空间中大量变化的方法。

作者:亚伦·伦[aut,cre]

维护人员:Aaron Lun<infinite.monkeys.with.keywords at gmail.com>亚伦·伦<infinite.monkeys.with.keywords at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“cydar”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“cydar”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文件

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“cydar”)
检测差异丰度 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 流式细胞术,免疫肿瘤学,多重比较,蛋白质组学,单个单元格,软件
版本 1.26.0
在生物导体中 生物活性炭3.5(R-3.4)(7年)
许可证 GPL-3公司
取决于 单细胞实验
进口 绿色,方法,光泽,图形,统计,grDevices,utils,生物遗传学,S4载体,生物并行,总结性实验,flowCore(流动堆芯),博科生物,卢比,生物邻居
系统要求 C++11语言
统一资源定位地址
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建议 ncdfFlow(ncdf流量)测试,rmarkdown,knitr,边缘R,利马、glmnet、,仿生风格,流量统计信息
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 赛达尔_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 赛达_1.26.0.zip
macOS二进制(x86_64) 赛达尔_1.26.0.tgz
macOS二进制(arm64) 赛达尔_1.26.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cydar
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/cydar
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/cydar/
包短Url https://bioconductor.org/packages/cydar/
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