西班牙猎犬
空间转录组学分析
生物导体版本：释放（3.19）
Spaniel包括一系列工具，用于帮助空间转录组学数据的质量控制和分析。西班牙猎犬可以从原始的空间转录组学系统或10X Visium技术导入数据。该软件包包含创建SingleCellExperimenta-Seura对象的函数，并提供了将组织学图像加载到R中的方法。spanielPlot函数允许将S4对象中包含的指标可视化，并覆盖到组织图像上。
作者：瑞秋·昆[aut，cre]
维护人员：瑞秋·昆（Rachel Queen）<Rachel.Queen at newcastle.ac.uk>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“猎犬”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
browseVignettes（“猎犬”）
细节
| 生物视图 |
聚类,新闻报道,数据导入,数据表示,基因表达式,基础设施,规范化,预处理,质量控制,RNA序列,排序,单个单元格,软件,转录组学,可视化 |
| 版本 |
1.17.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术3.10（R-3.6）（4.5年） |
| 许可证 |
MIT+文件许可证 |
| 取决于 |
R（>=4.0） |
| 进口 |
修拉，单细胞实验,摘要实验，dplyr，方法，ggplot2，散射(>= 1.13),尖叫声，igraph，有光泽，jpeg，magrittr，utils，S4载体,DropletUtils公司，jsonlite，png |
| 系统要求 |
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| 统一资源定位地址 |
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查看更多
| 建议 |
knitr、rmarkdown、testtat、devtools |
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生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
