包裹 |
维护人员 |
标题 |
注释 |
生物导体包维护器 |
基因组注释资源 |
阵列 |
生物导体包维护器 |
使用生物导体进行微阵列分析 |
BiocMetaWorkflow(生物元工作流) |
迈克·史密斯 |
关于发布BioC工作流的BioC工作流程 |
BP4RNA序列 |
孙善文 |
用于可重复RNA-seq分析的保姆包 |
CAGE工作流 |
马尔特·托德伯格 |
使用R/Bioconductor分析CAGE数据的分步指南 |
芯片序列数据库 |
亚伦·伦 |
检测ChIP-seq数据中差异结合的生物导体工作流 |
csaw用户指南 |
亚伦·伦 |
csaw用户指南 |
cytof工作流 |
马克·D·罗宾逊 |
CyTOF工作流:高通量高维细胞术数据集中的差异发现 |
EGSEA123公司 |
马修·瑞奇 |
利用EGSEA进行简单高效的集成基因集测试 |
ExpHunter套件 |
詹姆斯·珀金斯 |
转录组数据综合分析包 |
表达式规范化工作流 |
卡西基安·穆鲁格桑(Karthikeyan Murugesan) |
基因表达规范化工作流 |
流动基因组学 |
斯图亚特·李 |
plyranges和tximeta工作流 |
基因调控 |
生物导体包维护器 |
通过序列匹配找到已知转录因子的候选结合位点 |
GeoMx工作流 |
麦迪·格里斯沃尔德 |
GeoMx数字空间轮廓仪(DSP)数据分析工作流 |
高通量分析 |
生物导体包装维护人员 |
使用高通量分析的生物导体 |
提升(liftOver) |
生物导体包维护器 |
使用rtracklayer::liftOver更改基因组坐标系 |
maEnd到End |
斯蒂芬妮·雷塞纳(Stefanie Reisenauer) |
使用Affymetrix微阵列实现差异基因表达的端到端工作流程 |
甲基化阵列分析 |
约瓦娜·马克西莫维奇 |
用于分析甲基化阵列数据的跨包Bioconductor工作流。 |
重新计票工作流 |
莱昂纳多·科拉多·托雷斯 |
重新叙述工作流程:使用Bioconductor访问70000多个人类RNA-seq样本 |
RNA序列123 |
马修·瑞奇 |
RNA-seq分析与limma、Glimma和edgeR一样简单 |
rna序列DTU |
迈克尔·洛夫 |
鲑鱼量化后差异转录使用的RNA-seq工作流程 |
rna序列基因 |
迈克尔·洛夫 |
RNA-seq工作流程:基因水平探索性分析和差异表达 |
RnaSeqGeneEdgeRQL |
陈云顺 |
使用Rsubread和edgeR准相似管道进行基因级RNA-seq差异表达和通路分析 |
seqpac公司 |
丹尼尔·纳特 |
Seqpac:R中使用基于序列的计数进行小RNA分析的框架 |
排序 |
生物导体包维护器 |
序列数据生物导体简介 |
简单单细胞 |
亚伦·伦 |
使用Bioconductor对单细胞RNA-seq数据进行低级分析的分步工作流程 |
SingscoreAML变化 |
达尔梅什·D·布瓦 |
使用singscore从转录组特征预测AML突变 |
spicyWorkflow(spicy工作流) |
SOMS维护人员 |
执行多路组织成像数据的空间分析 |
TCGA工作流 |
蒂亚戈·切德劳伊·席尔瓦 |
TCGA工作流程使用Bioconductor软件包分析癌症基因组学和表观基因组学数据 |
变体 |
生物导体包维护器 |
注释基因组变异 |