此网站上的搜索功能当前不可用。
使用谷歌搜索类型网址:bioconductor.org“搜索词”在浏览器中。

多萝西娅

人和鼠TF调节子的收集


生物导体版本:释放(3.18)

DoRothEA是一个包含标记转录因子(TF)-靶基因相互作用的基因调控网络。DoRothEA调节子是TF及其转录靶点的集合,从人类和小鼠的不同类型证据中收集整理。根据支持证据的数量为每个TF-目标交互分配一个置信水平。

作者:Pau Badia-i-Mompel[创建],丹尼尔·迪米特洛夫[aut],克里斯蒂安·霍兰德[aut],Luz Garcia Alonso[aut],Alberto Valdeolivas[ctb],Minoo Ashtiani[ctb],Attila Gabor[ctb]

维护人员:Pau Badia-i-Mompel<uni-heidelberg.de>的Pau.Badia

引文(从R中输入引文(“多萝西娅”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.软件包(“BiocManager”)BiocManager::安装(“dorothea”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“dorothea”)
DoRothEA调节子。 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 实验数据,人乳头数据,Mus_肌肉_数据
版本 1.14.1
许可证 GPL-3+文件许可证
取决于 R(>=4.0)
进口 dplyr、magrittr、,bcellViper公司,解耦器R
系统要求
统一资源定位地址 https://saezlab.github.io/dorothea网站/ https://github.com/saezlab/dorothea网站
错误报告 https://github.com/saezlab/dorothea/issues
查看更多
建议 博科生物,仿生风格,全能运动员,毒蛇、knitr、pheatmap、pkgdown、rmarkdown、Seurat、,单细胞实验,总结性实验,测试(>=2.1.0),tibble,tidyr,utils
链接到
增强功能
取决于我
导入我 宇宙R,更容易的
建议我 MethReg公司
链接到我
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 多萝西娅_1.14.1.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dorothea网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/dorothea
包短Url https://bioconductor.org/packages/dorothea网站/
软件包下载报告 下载统计信息