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HCA数据

在R/Bioconductor中访问人类细胞图谱的数据集


生物导体版本:释放(3.18)

此软件包允许直接访问人类细胞地图集项目生成的数据集,以便在R和Bioconductor中以SingleCellExperiment对象的舒适格式进行进一步处理(此处提供其他格式:http://preview.data.humancellatlas.org/).

作者:费德里科·马里尼

维护人员:费德里科·马里尼(Federico Marini)

引文(从R中输入引文(“HCAData”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.软件包(“BiocManager”)BiocManager::安装(“HCAData”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“HCAData”)
访问人类细胞图谱数据集 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 实验数据,实验中心,表达式数据,RNASeq数据,单细胞数据
版本 1.18.0
许可证 MIT+文件许可证
取决于 R(>=3.6),单细胞实验
进口 实验中心,批注Hub,HDF5阵列,实用程序
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/federicomarini/HCAData网站
查看更多
建议 knitr、rmarkdown、,仿生风格,尖叫声(>= 1.11.4),BiocSingular公司,散射,舷窗、Rtsne、igraph、,iSEE公司,测试
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程序包档案

跟随安装在您的R会话中使用此软件包的说明。

源程序包 HCA数据_1.18.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HCAD数据
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/HCAData
包短Url https://bioconductor.org/packages/HCAD数据/
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