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轨迹实用程序

单细胞轨迹分析实用程序


生物导体版本:释放(3.18)

实现用于单单元轨迹分析的低级实用程序,主要用于在高级包中重用。包含一个函数,用于创建集群级最小生成树和数据结构,以保存伪时间推断结果。

作者:艾伦·伦[aut,cre],凯利街[aut]

维护人员:亚伦·伦(Aaron Lun)<infine.monkeys.with.keyboards at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“TrajectoryUtils”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“TrajectoryUtils”)

对于旧版本的R,请参阅相应的生物导体释放.

文件

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“轨迹实用程序”)
轨迹实用程序 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式

细节

生物视图 基因表达式,单个单元格,软件
版本 1.10.1
在生物导体中 生物化学3.13(R-4.1)(3年)
许可证 GPL-3公司
取决于 单细胞实验
进口 方法、统计、矩阵、图表,S4载体,总结性实验
系统要求
统一资源定位地址 https://bioconductor.org/packages/TrajectoryUtils网站
错误报告 https://github.com/LTLA/TrajectoryUtils/issues
查看更多
建议 生物邻居,DelayedArray(延迟阵列),延迟矩阵统计,生物并行,测试者,编织者,仿生风格、rmarkdown
链接到
增强功能
取决于我 弹弓,TSCAN公司
导入我 调味品,单细胞TK,tradeSeq(交易序列)
建议我
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生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 轨迹实用程序_1.10.1.tar.gz
Windows二进制 轨迹实用程序_1.10.1.zip
macOS二进制(x86_64) 轨迹工具_1.10.1.tgz
macOS二进制(arm64) 轨迹工具_1.10.1.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TrajectoryUtils网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/TrajectoryUtils
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/TrajectoryUtils网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/TrajectoryUtils网站/
软件包下载报告 下载统计信息
BioC 3.18的旧源程序包 源存档