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牢房工作台

构建单细胞分析方法的基准


生物导体版本:释放(3.18)

该包包含用于基准测试分析方法和访问单细胞混合物基准测试数据的基础设施。它提供了一个框架,用于组织分析方法和测试管道中的方法组合,而无需明确列出每个组合。它还提供了用于采样和过滤SingleCellExperiment对象、构造具有不同参数的函数列表以及分析方法的多线程评估的实用程序。

作者:Shian Su[cre,aut],Saskia Freytag[aut],Luyi Tian[aut],Xueyi Dong[aut],Matthew Ritchie[aut],Peter Hickey[ctb],Stuart Lee[ctb]

维护人员:Shian Su<Su.s at wehi.edu.au>

引文(从R中输入引文(“CellBench”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)生物管理器::安装(“CellBench”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“CellBench”)
数据操作 HTML格式 R脚本
介绍 HTML格式 R脚本
Tidyverse模式 HTML格式 R脚本
时间安排 HTML格式 R脚本
书写包装纸 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 基础设施,单个单元格,软件
版本 1.18.0
在生物导体中 生物技术3.9(R-3.6)(5年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=3.6),单细胞实验,magrittr,方法,统计,tibble,utils
进口 断言,生物遗传学,生物文件缓存,生物并行,dplyr,rlang,glue,memoise,purrr(>=0.3.0),rapdirs,tidyr,tidyselect,杂交
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/shians/cellbench
错误报告 https://github.com/Shians/CellBench/issues
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 牢房工作台_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 CellBench_1.18.0.zip手机(仅64位)
macOS二进制(x86_64) CellBench_1.18.0.tgz手机
macOS二进制(arm64) CellBench_1.18.0.tgz手机
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CellBench
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/CellBench
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/CellBench网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/CellBench网站/
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