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实验子集

使用生物导体实验对象管理数据子集


生物导体版本:释放(3.18)

实验对象(如SummarizedExperiment或SingleCellExperiment)是一个或多个类矩阵分析以及相关行和列数据的数据容器。下游分析通常只需要原始数据的一个子集。例如,筛选出质量较差的样本需要在分析之前排除一些列。ExperimentSubset对象是一个容器,可以有效地管理同一数据的不同子集,而无需为每个新子集创建单独的对象。

作者:伊尔扎姆·萨尔弗雷兹[aut,cre],穆罕默德·阿西夫[aut,ths],约书亚·D·坎贝尔[aut]

维护人员:Irzam Sarfraz<irzam9095,网址:gmail.com>

引文(从R中输入引文(“实验子集”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“ExperimentSubset”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“实验子集”)
实验子集课程简介 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 数据导入数据表示基础设施软件
版本 1.12.0
在生物导体中 生物柴油3.12(R-4.0)(3.5年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于 R(>=4.0.0),总结性实验单细胞实验空间实验树总结实验
进口 方法,矩阵,S4载体
系统要求
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 实验子集_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 实验子集_1.12.0.zip
macOS二进制(x86_64) 实验子集_1.12.0.tgz
macOS二进制(arm64) 实验子集_1.12.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ExperimentSubset
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ExperimentSubset
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/ExperimentSubset/
包短Url https://bioconductor.org/packages/ExperimentSubset/
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