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第1卷第6期
探索系统生物学模型动力学的逆特征值问题

詹姆斯·卢

内政部: 10.4208/aamm.09-m09S04

高级申请。数学。机械。,1(2009年),第711-728页。

在线发布:2009-01

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  • 摘要

本文描述了在研究系统生物学模型中的定性动力学。提出了基于lift和project迭代的算法,其中提升步骤需要求解约束矩阵逆特征值问题。特别是,在执行迭代步骤之前,$a$-$priori$在雅可比矩阵的项是根据反应网络结构以及所考虑模型的速率定律表达式。对多个模型的数值结果表明,所提出的算法可用于计算探索可能的动态场景,同时识别重要的通过使用稀疏促进正则化的机制。

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65F18、93B55、65P30、37N25、15A29

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本文描述了在研究系统生物学模型中的定性动力学。提出了基于lift和project迭代的算法,其中提升步骤需要求解约束矩阵逆特征值问题。特别是,在执行迭代步骤之前,$a$-$priori$在雅可比矩阵的项是根据反应网络结构以及所考虑模型的速率定律表达式。在多个模型上的数值结果表明该算法可以用于计算探索可能的动态场景,同时识别重要的通过使用稀疏促进正则化的机制。

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本文描述了在研究系统生物学模型中的定性动力学。提出了基于lift和project迭代的算法,其中提升步骤需要求解约束矩阵逆特征值问题。特别是,在执行迭代步骤之前,$a$-$priori$在雅可比矩阵的项是根据反应网络结构以及所考虑模型的速率定律表达式。对多个模型的数值结果表明,所提出的算法可用于计算探索可能的动态场景,同时识别重要的通过使用稀疏促进正则化的机制。

詹姆斯·卢(1970)。探索系统生物学模型动力学的逆特征值问题。应用数学与力学进展.1(6).711-728.doi:10.4208/aamm.09-m09S04
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