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生物文件缓存

跨会话管理文件


生物导体版本:释放(3.19)

此软件包创建了一个持久的磁盘上文件缓存,用户可以添加、更新和检索这些文件。它对于管理昂贵或难以创建的资源(如自定义Txdb对象)、web资源和跨会话使用的数据文件非常有用。

作者:洛里·谢泼德[aut,cre],马丁·摩根[aut]

维护人员:洛丽·谢泼德(Lori Shepherd)<Lori.Shepherd at roswellpark.org>

引文(从R中输入引文(“BiocFileCache”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“BiocFileCache”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“BiocFileCache”)
BiocFileCache:跨会话管理文件资源 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 数据导入,软件
版本 2.12.0
在生物导体中 生物活性炭3.5(R-3.4)(7年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=3.4.0),dbplyr(>=1.0.0)
进口 methods、stats、utils、dplyr、RSQLite、DBI、filelock、curl、httr
系统要求
统一资源定位地址
错误报告 https://github.com/Bioconductor/BiocFileCache/issues网站
查看更多
建议 测试一下,knitr,仿生风格、rmarkdown、,rtracklayer公司
链接到
增强功能
取决于我 批注中心,轻松自如,实验中心,日本2022,日本2024,Rcwl管道,scATAC。资源管理器,TM浏览器
导入我 阿尔法MissenseR,阿马雷托,在SNP,自治,贝叶斯空间,生物检测,BiocHail公司,生物包装工具,生物数据库,生物电阻,BioPlex公司,布伦达Db,错误信息br,cbaf公司,cBioPortalData公司,CBN图,牢房工作台,CTD查询器,自定义CMPdb,细胞管道,depmap(深度映射),DeProViR软件,DNAZooData公司,药物靶向相互作用,easyRNA序列,enhancer同源搜索,EnMCB公司,扩展浏览器,EpiTxDb公司,围栏,fgga公司,四个DN数据,格迪,geneplast.数据,基因组得分,基因组超级签名,ggkegg公司,GSEA基准,格瓦斯卡特,hca公司,HiContacts数据,HPO.db(水电站数据库),iSEE索引,MBQN公司,MetaScope(元作用域),微生物基准数据,MIRit公司,MPO.db公司,净Dx,NxtIRF数据,本体程序,ORFik公司,org.Maxantus.db网站,有机体.dplyr,正交数据,PANTHER.db公司,PhIP数据,心灵病学,rBLAST公司,重新计票3,重新计算甲基化,regutools公司,重新使用数据,RiboDiPA公司,rpx公司,scviR公司,芝麻,SFE数据,签字人,单细胞多模式,SingscoreAML变化,空间实验,空间LIBD,空间Omics叠加,拼接向导,冲浪者,terraTCGA数据,TFutils(TFutils),托马斯克,tximeta公司,UMI4猫,取消覆盖库,UniProt.ws公司,waddR(涉水)
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 生物文件缓存_2.12.0.tar.gz
Windows二进制 生物文件缓存_2.12.0.zip
macOS二进制(x86_64) 生物文件缓存_2.12.0.tgz
macOS二进制(arm64) 生物文件缓存_2.12.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocFileCache(生物文件缓存)
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/BiocFileCache
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/BiocFileCache/
包短Url https://bioconductor.org/packages/BiocFileCache/
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