格瓦斯卡特

在EMBL-EBI GWAS目录中表示和建模数据

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.软件包（“BiocManager”）BiocManager:：install（“gwascat”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“gwascat”）

gwascat—EBI目录中GWAS点击量的G范围	HTML格式	R脚本
gwascat：构建和查询NHGRI GWAS目录	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

细节

生物视图	遗传学,软件
版本	2.34.0
在生物导体中	生物技术2.10（R-2.15）（12年）
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=3.5.0），方法
进口	S4矢量(>= 0.9.25),I范围,基因组信息Db,基因组范围(>= 1.29.6),基因组特征，读卡器，生物串,注释Dbi,生物文件缓存,snpStats（snpStat）,变量注释,批注Hub
系统要求
统一资源定位地址

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建议	出生日期.db，DT，针织者，RBGL公司，测试，rmarkdown，dplyr，Gviz公司,Rsamtools软件,rtracklayer公司,图表,ggbio公司,DelayedArray（延迟阵列）,TxDb（发送日期）。哈皮恩斯。UCSC.hg19.known基因,组织Hs.eg.db,生物风格
链接到
增强功能	SNPlocs公司。Hsapiens.dbSNP144.GRCh37型
取决于我	提升（liftOver）,vtpnet（vtpnet）
导入我	循环RNA分析器
建议我	基因组得分,抓地力2db,hmdb查询,ld块,帕格尔姆,TFutils（TFutils）
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在您的R会话中使用此软件包的说明。

源程序包	格瓦萨特2.34.0.tar.gz
Windows二进制	gwascat_2.34.0.zip文件（仅64位）
macOS二进制（x86_64）	格瓦萨特2.34.0.tgz
macOS二进制（arm64）	格瓦萨特2.34.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gwascat网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：packages/gwascat
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/gwascat网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/gwascat网站/
软件包下载报告	下载统计信息