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cbaf公司

用于比较cbioportal.org中各种经济数据的自动化功能


生物导体版本:释放(3.18)

该软件包包含一些功能,可以方便地分析和比较各种癌症/癌症亚组的组学数据。到目前为止,它与储存在cbioportal.org上的RNA-seq、microRNA-seq、微阵列和甲基化数据集兼容。

作者:阿尔曼·沙赫里萨[aut,cre,cph],玛丽亚姆·塔马塞比·比尔加尼[aut]

维护人员:阿曼·沙赫里萨(Arman Shahrisa)<Shahrisa.Arman at hotmail.com>

引文(从R中输入引文(“cbaf”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.软件包(“BiocManager”)BiocManager::安装(“cbaf”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“cbaf”)
cbaf公司 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 分析域,生物医学信息学,比较基因组学,DNA甲基化,表观遗传学,基因表达式,遗传学,微阵列,研究领域,软件,转录,转录组学
版本 1.24.0
在生物导体中 生物技术3.6(R-3.4)(6.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=4.1)
进口 生物文件缓存、R Color Brewer、,cBioPortalData公司,基因过滤器、gplots、grDevices、stats、utils、openxlsx
系统要求
统一资源定位地址
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建议 knitr、rmarkdown、,生物风格
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程序包档案

跟随安装在您的R会话中使用此软件包的说明。

源程序包 cbaf_1.24.0.tar.gz公司
Windows二进制 cbaf_1.24.0.zip
macOS二进制(x86_64) cbaf_1.24.0.tgz
macOS二进制(arm64) cbaf_1.24.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cbaf网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/cbaf
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/cbaf/
包短Url https://bioconductor.org/packages/cbaf/
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