cbaf公司
用于比较cbioportal.org中各种经济数据的自动化功能
生物导体版本:释放(3.18)
该软件包包含一些功能,可以方便地分析和比较各种癌症/癌症亚组的组学数据。到目前为止,它与储存在cbioportal.org上的RNA-seq、microRNA-seq、微阵列和甲基化数据集兼容。
作者:阿尔曼·沙赫里萨[aut,cre,cph],玛丽亚姆·塔马塞比·比尔加尼[aut]
维护人员:阿曼·沙赫里萨(Arman Shahrisa)<Shahrisa.Arman at hotmail.com>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.软件包(“BiocManager”)BiocManager::安装(“cbaf”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“cbaf”)
细节
生物视图 |
分析域,生物医学信息学,比较基因组学,DNA甲基化,表观遗传学,基因表达式,遗传学,微阵列,研究领域,软件,转录,转录组学 |
版本 |
1.24.0 |
在生物导体中 |
生物技术3.6(R-3.4)(6.5年) |
许可证 |
艺术-2.0 |
取决于 |
R(>=4.1) |
进口 |
生物文件缓存、R Color Brewer、,cBioPortalData公司,基因过滤器、gplots、grDevices、stats、utils、openxlsx |
系统要求 |
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统一资源定位地址 |
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查看更多
建议 |
knitr、rmarkdown、,生物风格 |
链接到 |
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增强功能 |
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取决于我 |
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导入我 |
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建议我 |
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指向我的链接 |
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生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在您的R会话中使用此软件包的说明。