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EpiTxDb公司

使用AnnotationDbi接口存储和访问外延信息


生物导体版本:释放(3.18)

EpiTxDb促进了上转录信息的存储。更具体地说,它可以跟踪修饰的身份、位置、将其引入RNA的酶、确定待修饰RNA上的位置的说明符以及与每个修饰相关的文献参考。

作者:费利克斯·G·M·恩斯特[aut,cre]

维护人员:Felix G.M.Ernst<Felix.gm.Ernst at outlook.com>

引文(从R中输入引文(“EpiTxDb”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“EpiTxDb”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“EpiTxDb”)
EpiTxDb公司 HTML格式 R脚本
EpiTxDb-创建 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 表转录组学软件
版本 1.14.1
在生物导体中 生物柴油3.11(R-4.0)(4年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=4.0),注释DbiModstrings模式
进口 方法,utils,httr,xml2,curl,基因组学特征基因组范围基因组信息数据库生物遗传学生物文件缓存S4载体I范围、RSQLite、DBI、,生物串tRNAdb导入
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/FelixErnst/EpiTxDb
错误报告 https://github.com/FelixErnst/EpiTxDb/问题
查看更多
建议 仿生风格、knitr、rmarkdown、testtat、httptest、,批注中心集成数据库,ggplot2,EpiTxDb。Hs.hg38型英国基因组。哈皮恩斯。加州大学旧金山分校hg38英国基因组。Scerevisiae公司。UCSC.sacCer3发送数据库。哈皮恩斯。UCSC.hg38.known基因
链接到
增强功能
取决于我 EpiTxDb。Hs.hg38型EpiTxDb。毫米10EpiTxDb。Sc.sacCer3证书
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 EpiTxDb_1.14.1.tar.gz(英文)
Windows二进制 EpiTxDb_1.14.1.zip
macOS二进制(x86_64) EpiTxDb_1.14.1.tgz公司
macOS二进制(arm64) EpiTxDb_1.14.1.tgz公司
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EpiTxDb
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/EpiTxDb
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/EpiTxDb/
包短Url https://bioconductor.org/packages/EpiTxDb/
软件包下载报告 下载统计信息
BioC 3.18的旧源程序包 源存档