（IUCr）结晶学报第D节第70卷第7部分，2014年7月

《水晶学报》。(2014).D类70,1790-1800
https://doi.org/10.107/S1399004714004684

Z-DNA十二聚体中的磷酸盐是柔性的，但其P-SAD信号足以用于结构溶液

Z.罗,M.道特和Z.道特

Z-DNA十二聚体的超高分辨率结构由P原子的异常信号解析而来，揭示了主链磷酸基团的巨大灵活性。

PDB参考:d（CGCGCGCG）₂，4个ocb

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细菌周质唾液酸结合蛋白具有保守的结合位点

T.甘吉·塞蒂,C.Cho公司,S.戈文达帕,阿皮塞拉M.A和S.Ramaswamy公司

唾液酸结合蛋白的结构-功能研究有核F,多杀性P,霍乱弧菌和流感嗜血杆菌揭示了与配体结合构象变化有关的保守氢键网络。

PDB参考:唾液酸结合蛋白多杀性巴氏杆菌，4毫米;从核梭杆菌，400万英镑;从霍乱弧菌，4毫克

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人Fas凋亡抑制分子的结构测定及其与抗凋亡活性相关的关键残基的鉴定

G.李,L.Qu公司,S.Ma公司,吴彦祖（Y.Wu）,C.金和X.郑

测定了人Fas凋亡抑制分子N端和C端结构域。两个结构域的结构和生化分析将结构域间的相互作用与抗凋亡活性联系起来。

PDB参考:FAIM-S，NTD，3mx7;CTD，2kw1

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脱氧400的结构 kDa血红蛋白揭示了巨大血红蛋白的三元和四元结构变化

N.努莫托,T.中川,R.Ohara先生,T.长谷川,A.基塔,吉田（T.Yoshida）,T.丸山,K.伊迈,Y.Fukumori（福森）和K.米奇

400的脱氧形式的结构来自管蠕虫的kDa血红蛋白温州乳杆菌已报告。

PDB参考:V2Hb，氧化形式，3wct;脱氧形式，3wcu;钙²⁺-绑定形式，3wcv;镁²⁺-绑定形式，3wcw

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赖氨酸特异性内蛋白酶的原子分辨结构溶菌酶酶原表明羟基与氧阴离子孔结合

P.阿斯塔洛斯,A.米勒,沃尔克,H.索贝克和M.G.鲁道夫

野生型晶体结构产酶类在与模拟四面体反应中间体的共价抑制剂TLCK的络合物中测定了底物结合位点附近的LysC和K30R变体。H原子密度表示氧阴离子空穴中的羟基。

PDB参考:LysC，野生型，4nsy;K30R突变体，4nsv

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用稀疏密度表示法自动识别晶体配体

C.G.卡罗兰和V.S.兰津

介绍了一种识别大分子晶体电子密度图中配体的新方法。这种图谱中的密度簇可以自动快速地归因于82种不同配体中的一种。

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纳⁺/K（K）⁺交换开关钾依赖工厂的催化装置L（左）-天冬酰胺酶

M.贝杰,B.伊莫尔奇克,D.抓斗,M.吉尔斯基,A.帕亚克,F.马尔索利斯和雅斯科尔斯基

钾依赖植物的三种晶体结构L（左）-天冬酰胺酶在与K的络合物中溶解⁺，与Na一起⁺以及两种阳离子。一种新的碱金属结合环Val111–Ser118（激活环）在K时改变其构象⁺/纳⁺交换，导致三个关键残基His117、Arg224和Glu250（催化开关）的重新配置，以允许或阻止酶活性部位的底物结合。

PDB参考:PvAspG1–K/Na，4pv2;PvAspG1–K，4pu6;PvAspG1–钠，4pv3

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利用重原子衍生物的细微结构差异进行实验相位调整

J.Wang（王）,Y.Li（李彦宏）和Y.莫迪斯

可以利用重原子导数之间的微小差异，通过将每个导数视为一个独立的SAD数据集，并将这些数据集与SIR数据集的循环置换对相结合，来改进实验阶段。这种普遍适用的方法的基础是，高度同构导数之间同构信号的有效分辨率通常远高于单个导数数据集异常信号的有效分辨力。

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一种新型卤代烷脱卤酶的结构和功能分析

查洛普科娃,T.普鲁德尼科娃,雷扎科娃P,Z.普罗科普,T.库德拉科娃,L.丹尼尔,J.布雷佐夫斯基,W.Ikeda-Ohtsubo公司,Y.佐藤,M.库蒂,Y.Nagata（永田）,I.库塔·斯马塔诺娃和J.丹博斯基

在新分离的卤代烷脱卤酶DbeA的晶体结构中鉴定出两个卤素结合位点埃氏慢生根瘤菌USDA94。消除第二个卤化物结合位点显著改变了酶的底物特异性、催化活性和在氯化物存在下的稳定性。卤代烷脱卤酶突变后底物特异性类别发生了变化，这是首次证明。

PDB参考:DbeA，4k2a

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猫配体T态血红蛋白的结构(家猫)，一种低氧亲合性物种，具有两种不同的晶体形式

巴拉苏布拉曼尼亚（M.Balasubramanian）,P.萨提亚·莫尔蒂,K.内拉甘丹,R.Ramadoss（拉马多斯）,P.R.科拉特卡尔和M.N.蓬努斯瓦米

配体cat Hb的结构因其配体结合特性而采用T态类四元结构，包括低协同性、配体亲和力和对变构效应器的钝反应。

PDB参考:猫血红蛋白2.4 奥，3gqr;猫血红蛋白2.0 奥，3gqp

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的结构大肠杆菌Grx2与谷胱甘肽的复合物：谷胱甘苷氧还蛋白和谷胱甘蛋白的双功能混合物S公司-转移酶

J.叶,S.V.纳达尔,J.李和B.P.罗森

谷胱甘肽2（Grx2）的结构大肠杆菌在1.60与谷胱甘肽（GSH）共结晶报道了Å分辨率。

PDB参考:Grx2–GSH复合体，4kx4;Grx2 C9S/C12S突变体，4ksm

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C/EBP转录激活子与p300 Taz2结构域相互作用的结构见解

普豪米克,J.戴维斯,J.E.Tropea公司,S.樱桃,P.F.约翰逊和M.米勒

由p300 Taz2残基1723-1818和C/EBP残基37-61组成的嵌合蛋白结构中的晶体接触揭示了C/EBP转录激活剂与p300/CBP相互作用的可能模式。

PDB参考:C/EBP∊-p300 Taz2嵌合体，3t92

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耐多药菌株丙氨酸外消旋酶的结构和生化分析艰难梭菌应变630

O.A.Asojo先生,S.K.纳尔逊,S.Mootien公司,Y.Lee先生,W.C.雷泽德,D.A.海曼,M.M.松本,S.Reiling公司,A.凯莱赫,M.莱迪泽,R.A.Koski先生和K.G.安东尼

的结构艰难梭菌介绍了丙氨酸消旋酶和PLP辅因子和环丝氨酸的配合物。

PDB参考:CdAlr，与PLP复合物，4lus;环丝氨酸络合物，4lut;K271T突变体，与PLP复合，4luy

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ICAM-5胞外区片段的晶体结构显示出基于静电的亲同性粘附

R.雷卡查,D.吉梅内斯,L·田,R.巴雷多,C.G.Gahmberg（加姆伯格）和J.M.卡萨斯诺娃

细胞间粘附分子-5（ICAM-5）的晶体结构显示出基于电荷的同型相互作用以及神经元中潜在的ICAM-5细胞粘附复合体。

PDB参考:ICAM-5 D1–D4，4oi9;4磅;4年一遇

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Hippo信号通路中MST和RASSF SARAH结构域异源二聚化的结构基础

E.黄,H.K.Cheong公司,A.U.穆斯塔克,H.Y.Kim先生,杨家杰（K.J.Yeo）,E.金,W.C.李,黄光裕,C.张和Y.H.Jeon先生

介绍了MST1和RASSF5 SARAH结构域的异二聚体结构。同二聚体和异二聚体相互作用的比较为SARAH异二聚物的优先结合提供了结构基础。

PDB参考:MST1–RASSF5 SARAH异二聚体，4oh8;MST2 SARAH同二聚体，4oh9

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前所未见的构象灵活性显示在羊波维科拉蜕皮激素受体（EcR）和超螺旋体（USP）亚单位

B.任,T.S.泥炭,V.A.Streltsov公司,M.波拉德,R.Fernley公司,J.格鲁索芬,S.Seabrook公司,P.起球,T.Phan公司,L.Lu先生,G.O.洛夫雷茨,L.D.格雷厄姆和R.J.希尔

异二聚体配体结合域的晶体结构绵羊布鲁菌蜕皮激素受体分别在蜕皮激素和合成亚甲基内酰胺杀虫剂存在下被溶解。对这些结构的分析揭示了蜕皮激素受体在配体结合时的新的构象灵活性。

PDB参考:BoEcR–BoUSP，与亚甲基内酰胺共结晶，4盎司;4盎司磷甾酮A复合物

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家族性部分性脂肪营养不良相关人类PPARγF360L突变体反式激活缺陷的结构基础

C.洛里,A.帕斯科,R.蒙塔纳里,D.卡佩利,V.康萨尔维,R.Chiaraluce公司,L.塞尔沃尼,F.碘,A.拉赫扎,M.Aschi先生,A.乔治和G.波切蒂

PPARγF360L–LT175复合物的晶体结构的阐明为该突变的反式激活缺陷的结构基础提供了相当深入的见解，该突变与家族性部分性脂肪营养不良有关。

PDB参考:PPARγF360L，与LT175，4l96的络合物;1998年4月;PPARγR357A，与罗格列酮的络合物，4o8f

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核磁共振模型的结晶定相：包络方法

W.Zhang先生,T·张,H.张和Q.郝

报道了一种新的分子替换方法，该方法利用低分辨率核磁共振结构衍生的分子包络。

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Cwp84的半胱氨酸蛋白酶和凝集素样结构域的结构艰难梭菌

W.J.布拉德肖,J.M.柯比,N.蒂亚加拉扬,C.J.钱伯斯,A.H.戴维斯,A.K.罗伯茨,C.C.肖恩和K.R.阿查里亚

Cwp84的晶体结构艰难梭菌是第一次展示。本文描述了半胱氨酸蛋白酶结构域的组织蛋白酶L样折叠、一个新观察到的“类凝集素”结构域和几个其他特征。

PDB参考:Cwp84，4ci7

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结合Patterson和VLD公司技术

R.卡利安德罗,B.卡罗齐尼,G.L.卡斯卡拉诺,G.社区,C.贾科瓦佐和A.马佐尼

各种直接和往复空间技术被结合用于从头算蛋白质在非原子分辨率下的相位。

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NLRP14吡啶结构域的结构揭示了调控其分子相互作用的构象开关机制

C.埃布尔,M.赫森伯格,J.温格和H.Brandstetter公司

吡啶结构域（PYD）在NLR信号中招募下游效应分子。一个特定的电荷中继系统表明了一种涉及PYD二聚体的信号复合物的形成。

PDB参考:NLRP14 PYD，4n1j;D86V突变株，4n1k;L84R突变体，4n1l

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双活性PAP磷酸酶-1的结构鉴定溶组织内阿米巴能够水解3′-磷酸腺苷5′-磷酸和肌醇1,4-双磷酸

K.费萨尔·塔里克,S.Arif Abdul Rehman公司和S.Gourinath公司

PAP磷酸酶-1的晶体结构溶组织内阿米巴其与AMP的络合物测定为2.1和2.6 分别为？分辨率。这种酶是李氏的⁺-敏感镁²⁺-依赖性肌醇聚磷酸1-磷酸酶，催化3′-磷酸腺苷5′-磷酸和肌醇1,4-二磷酸的水解。

PDB参考:PAP磷酸酶-1，4o7i;与AMP复合，4hxv

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细胞分裂素特异性结合蛋白对赤霉素的特异性结合：植物激素结合蛋白PR-10折叠的新方向

M.Ruszkowski先生,J.斯利威克,A.西塞尔斯卡,J.巴西舍夫斯基,M.西科尔斯基和雅斯科尔斯基

两种植物细胞分裂素特异性结合蛋白与赤霉素（GA3）形成复合物结晶，赤霉素是一种完全不同的植物激素。在高分辨率下测定的晶体结构揭示了GA3结合的高度特异模式，需要用PR-10倍修正植物蛋白的激素特异性。

PDB参考:VrPhBP–GA3复合物，4psb;MtPhBP–GA3复合体，4q0k

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BuD，一个用于基因组修饰的螺旋-环-螺旋DNA结合域

S.斯特拉,R.莫利纳,B.洛佩斯·门德斯,A.Juillerat公司,C.伯托纳蒂,F.达博西,R.Campos-Olivas公司,P.Duchateau先生和G.蒙托亚

报道了BurrH和BurrH–DNA复合物的晶体结构。

PDB参考:阿波·伯尔H，4cj9;BurrH–DNA复合物，4cja

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周质铜结合蛋白CueP的结构肠道沙门菌鼠伤寒血清型。勘误表

B.Y.Yoon先生,Y.-H.金,N.金,B.-Y.Yun,J.-S.金,J.-H.李,H.-S.Cho先生,K·李和N.-C.哈

通过以下方式对文章进行更正Yoon公司等。[（2013）.D69, 1867–1875].

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发行内容

2014年7月发行

研究论文

Z-DNA十二聚体中的磷酸盐是柔性的，但其P-SAD信号足以用于结构溶液

细菌周质唾液酸结合蛋白具有保守的结合位点

人Fas凋亡抑制分子的结构测定及其与抗凋亡活性相关的关键残基的鉴定

脱氧400的结构 kDa血红蛋白揭示了巨大血红蛋白的三元和四元结构变化

赖氨酸特异性内蛋白酶的原子分辨结构溶菌酶酶原表明羟基与氧阴离子孔结合

用稀疏密度表示法自动识别晶体配体

纳⁺/K（K）⁺交换开关钾依赖工厂的催化装置L（左）-天冬酰胺酶

利用重原子衍生物的细微结构差异进行实验相位调整

一种新型卤代烷脱卤酶的结构和功能分析

猫配体T态血红蛋白的结构(家猫)，一种低氧亲合性物种，具有两种不同的晶体形式

的结构大肠杆菌Grx2与谷胱甘肽的复合物：谷胱甘苷氧还蛋白和谷胱甘蛋白的双功能混合物S公司-转移酶

C/EBP转录激活子与p300 Taz2结构域相互作用的结构见解

耐多药菌株丙氨酸外消旋酶的结构和生化分析艰难梭菌应变630

ICAM-5胞外区片段的晶体结构显示出基于静电的亲同性粘附

Hippo信号通路中MST和RASSF SARAH结构域异源二聚化的结构基础

前所未见的构象灵活性显示在羊波维科拉蜕皮激素受体（EcR）和超螺旋体（USP）亚单位

家族性部分性脂肪营养不良相关人类PPARγF360L突变体反式激活缺陷的结构基础

核磁共振模型的结晶定相：包络方法

Cwp84的半胱氨酸蛋白酶和凝集素样结构域的结构艰难梭菌

结合Patterson和VLD公司技术

NLRP14吡啶结构域的结构揭示了调控其分子相互作用的构象开关机制

双活性PAP磷酸酶-1的结构鉴定溶组织内阿米巴能够水解3′-磷酸腺苷5′-磷酸和肌醇1,4-双磷酸

细胞分裂素特异性结合蛋白对赤霉素的特异性结合：植物激素结合蛋白PR-10折叠的新方向

BuD，一个用于基因组修饰的螺旋-环-螺旋DNA结合域

补遗和勘误表

周质铜结合蛋白CueP的结构肠道沙门菌鼠伤寒血清型。勘误表

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