以非原子分辨率对蛋白质进行定相仍然是一个挑战从头算方法。各种算法[Patterson反褶积、叠加技术、互相关函数(C地图）VLD（VLD）(维拉差异)方法，FF函数，非线性迭代峰值削波算法(SNIP公司)用于定义地图的背景和免费午餐结合外推法]克服了缺乏非原子分辨率的实验信息的问题。该方法已应用于大量蛋白质衍射数据集，分辨率从原子级到2.1º不等，条件是蛋白质结构中存在S或更重的原子。应用程序包括使用ARP协议/弯曲客观地检查最终电子密度图的质量。结果表明，分辨率仍然是蛋白质阶段化的最大障碍，但也表明，对于阶段化程序中实现的组合算法集，以2.1°分辨率求解蛋白质结构是可行的，即使仍然是一项例外任务。这里描述的方法比前面描述的步骤更有效：例如。上述算法的组合使用通常能够提供足够高质量的阶段，以允许自动建模。该方法在的当前版本中实现统计资料记录2014
