阿普斯梅姆 swMATH ID: 22298 软件作者： 卡伦伯格，K.M。；乔达里，O.P。；de Forest，G.L。；戈哈拉，D.W。；贝克，N.A。；M.格雷布。 描述： APBSmem：膜上静电计算的图形界面。静电是分子相互作用的主要决定因素之一。它们有助于引导蛋白质的折叠，增加一种蛋白质与另一种蛋白质的结合，并促进蛋白质-DNA和蛋白质-甘氨酸的结合。计算生物系统静电特性的一种流行方法是数值求解泊松-玻尔兹曼（PB）方程，有几种易于使用的软件包可用于求解可溶性蛋白质的PB方程。在这里，我们提供了一个免费的程序，称为APBSmem，用于在有膜的情况下进行这些计算。自适应泊松-玻尔兹曼解算器（APBS）用作求解PB方程的后端，基于Java的图形用户界面（GUI）协调一组例程，这些例程引入膜的影响，确定其相对于蛋白质的位置，并设置膜电位。将软件Jmol嵌入GUI中，以可视化计算前插入膜中的蛋白质和计算完成后的静电势。我们预计，GUI允许用户轻松进行这些计算，这将使该软件成为实验者和计算研究人员的有用资源。通过三个膜蛋白静电计算示例，说明如何使用APBSmem，并强调可以计算的不同数量。 主页： https://apbsmem.sourceforge.io网址 相关软件： MIBPB公司;APBS公司;禁忌;TABI公司;TMSmesh公司;查姆;FFTSVD公司;AFMPB公司;环境与社会保障局;产品开发B2PQR;供应商管理部;HOT（热）;磁粉探伤;NAMD公司;德尔菲;蒸汽发生器;UHBD公司;格鲁马克斯 引用于： 4文件 全部的 前5名8位作者引用 三 耿伟华 1 埃米尔·阿列克索夫 1 陈家辉 1 罗伯特·克拉斯尼 1 李川 1 李，林 1 玛哈丽塔·佩图赫 1 赵珊 2篇连载文章中引用 三 计算物理杂志 1 基于分子的数学生物学 在4个字段中引用 4 生物学和其他自然科学（92-XX） 三 数值分析（65-XX） 2 光学、电磁理论（78-XX） 1 计算机科学（68至XX） 按年份列出的引文