VMD公司

VMD是一个分子可视化程序,用于显示、动画和分析大型生物分子系统,使用三维图形和内置脚本。VMD支持运行macosx、Unix或Windows的计算机,免费分发,并包含源代码。VMD用于蛋白质、核酸、脂质双层组装等生物系统的建模、可视化和分析。它可以用来查看更一般的分子,因为VMD可以读取标准蛋白质数据库(PDB)文件并显示包含的结构。VMD提供了各种各样的方法来渲染和着色一个分子:简单的点和线、CPK球体和圆柱体、甘草键、主干管和色带、卡通画等等。VMD可以用来制作和分析分子动力学(MD)模拟的轨迹。特别是,VMD可以作为外部MD程序的图形前端,通过在远程计算机上显示和模拟正在进行模拟的分子。


zbMATH参考文献(参考 81篇文章 参考)

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按年份排序(引用)
  1. Teixeira,J.M.:taurenmd:分子动力学模拟分析的命令行界面(2020)不是zbMATH
  2. 《新机制》;Niemanto Zhen,Niemanto Zhen;3D可视化技术;Niemanto Zhen
  3. Raos,Guido:分子几何学和分子图形学:Natta公司的聚丙烯及其以后(2019年)
  4. Robu,Andreea;Mironov,Vladimir;Neagu,Adrian:使用牺牲细胞球体进行可灌注3D组织和器官结构的生物打印:一项计算研究(2019年)
  5. 萨拉瓦南,坎大萨米;库马拉达斯,波曼尼:酰基胍-BACE1复合物:分子间相互作用和动力学的见解(2019年)
  6. Younes Nejahi;Mohammad Soroush Barhaghi;Jason Mick;Brock Jackman;Kamel Rushaidat;Yuanzhe Li;Loren Schwiebert;Jeffrey Potoff:GOMC:GPU优化蒙特卡罗模拟复杂流体的相平衡和物理性质(2019)不是zbMATH
  7. 《Valentina采矿法:比较分子动力学》(2018年,Tozzio《比较分子动力学》;摘自《卡米奥拉模式》)
  8. 丹尔,阿尼尔;林,林:通过纠缠解离:万尼尔局部化的统一方法(2018)
  9. 傅,易;赵,季;陈志国;陈晓乐:通过分子对接和分子动力学模拟洞察蛋白质-配体相互作用的分子机制:寡肽结合蛋白的案例(2018)
  10. Hudson,Robert B.;Sinha,Alok:带缺陷的碳纳米管的振动:有序还原方法(2018)
  11. 蒋希卓;冯,缪叶;罗,凯H;Ventikos,Yiannis:内皮细胞糖萼复杂结构下流动的大尺度分子动力学模拟(2018)
  12. Mezei,Mihaly:蛋白质数据库中变色龙序列的再研究(2018)
  13. Stritzler,Margarita;Berini,Carolina;Jozefkowicz,Cintia;Soto,Gabriela;Ayub,Nicolas:了解假单胞菌背景下聚羟基丁酸酯聚合酶的胞内到胞外定位开关,作为一种微进化过程(2018年)
  14. 卜炳;李德昌;刁佳杰;纪宝华:电场作用下脂膜孔隙形成机理(2017)
  15. Damle,Anil;Lin,Lin;Ying,Lexing:通过随机化和精化计算Kohn-Sham子空间的局部表示(2017)
  16. Fath,L.;Hochbruck,M.;Singh,C.V.:生物分子原子模拟的快速缓和脉冲法(2017)
  17. Michael E.Fortunato,Coray M.Colina:pysimm:用于模拟分子系统的python包(2017)不是zbMATH
  18. Gogolinska,Anna;Jakubowski,Rafal;Nowak,Wieslaw:Petri网形式化有助于复杂生物分子结构数据的分析(2016)
  19. Hoseinpoor,S.Mohammad;Nikoofard,Narges;Zahedifar,Mostafa:限制在圆柱形纳米通道内的柔性聚合物blob模型的精度限制(2016年)
  20. Kulik,Marta;Trylska,Joanna:氨基糖苷类化合物与核糖体A位点模型的结构和能量比较(2016)