格罗马克斯

GROMACS是一个多功能的软件包,用于执行分子动力学,即模拟含有数百到数百万个粒子的系统的牛顿运动方程。它主要用于生物化学分子,如蛋白质、脂类和核酸,这些分子有许多复杂的键合作用,但由于GROMACS在计算非键相互作用(通常主导模拟)方面速度极快,许多研究小组也将其用于非生物系统的研究,例如聚合物


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  2. 比崔彻,安德烈亚斯;克鲁斯,斯特凡;哈姆齐,布梅迪恩;科尔泰,佩特;Schütte,Christof:通过转移流形的核嵌入对复杂亚稳系统的降维(2021)
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  4. Luciano G.Silvestri,Lucas J.Stanek,Gautham Dharuman,Yongjun Choi,Michael S.Murillo:Sarkas:等离子体物理快速纯Python分子动力学套件(2021)阿尔十四
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  17. 莫塔梅迪,莫森;Ayesha Sohail:微管蛋白生物物理学的理论框架(2019)
  18. 路特,亚灰树;FalcortiTani蛋白质和分子动力学分析
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