格罗马克斯

GROMACS是一个多功能的软件包,用于执行分子动力学,即模拟含有数百到数百万个粒子的系统的牛顿运动方程。它主要用于生物化学分子,如蛋白质、脂类和核酸,这些分子有许多复杂的键合作用,但由于GROMACS在计算非键相互作用(通常主导模拟)方面速度极快,许多研究小组也将其用于非生物系统的研究,例如聚合物


zbMATH参考文献(参考 115篇文章

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按年份排序(引用)
  1. Mongelli,Guy Francis:分子动力学模拟。格罗马奇的关键业务(即将出现)(2022年)
  2. Younes Nejahi,Mohammad Soroush Barhaghi,Gregory Schwing,Loren Schwiebert,Jeffrey Potoff:GOMC更新2.70:GPU优化蒙特卡罗模拟复杂流体的相平衡和物理性质(2021)不是zbMATH
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  5. Agrahari,Ashish Kumar;Doss,George Priya C.;Siva,R.;Magesh,R.;Zayed,Hatem:与帕金森病相关的LRRK2激酶结构域中G2019S取代的分子见解:分子动力学模拟方法(2019年)
  6. Anupama,Rani;Lulu,Sajitha;Madhusmita,Rout;Vino,Sundararajan;Mukherjee,Amitava;Babu,Subramanian:对假单胞菌PAO1中关键生物膜蛋白与TiO(Ρ2)纳米颗粒相互作用的见解:一项不相干分析(2019年)
  7. 白晓璐;陈晓林:针对脓毒症革兰阳性临床菌株的Bac2A抗菌肽的合理设计、构象分析和膜渗透动力学研究(2019)
  8. Hopp Hirschler,Manuel;Baz,Jörg;Hansen,Niels;Nieken,Ulrich:光滑粒子流体动力学中相分离流体混合物的广义Fickian方法(2019)
  9. 厚实,武夫;伊马,广藤英美;久和,秋叶幸男;Kakuda,Kohsuke;Fujita,Takatoshi;Matsui,Hiroyuki:柔性器件材料大规模电子状态计算的数值方面(2019年)
  10. Lei,Huan;Li,Jing;Gao,Peiyuan;Stinis,Panagiotis;Baker,Nathan A.:具有任意相互依赖随机性的稀疏增强代理的数据驱动框架(2019)
  11. Long,Andrew W.;Ferguson,Andrew L.:地标扩散图(L-dMaps):样本外加速流形学习(2019年)
  12. Mohsen Motamedi;Ayesha Sohail:微管蛋白生物物理学的理论框架(2019年)
  13. Rout,Subhashree;Mahapatra,Rajani Kanta:\textITi恶性疟原虫CDPK5蛋白的分子建模、对接和动力学分析(2019年)
  14. van den Berg,E.:海洋张量包(2019)不是zbMATH
  15. Younes Nejahi;Mohammad Soroush Barhaghi;Jason Mick;Brock Jackman;Kamel Rushaidat;Yuanzhe Li;Loren Schwiebert;Jeffrey Potoff:GOMC:GPU优化蒙特卡罗模拟复杂流体的相平衡和物理性质(2019)不是zbMATH
  16. Bou Rabee,Nawaf;Sanz Serna,J.M.:几何积分器和哈密顿蒙特卡罗方法(2018)
  17. 龚丽华,何向涛,谭汝超,周志红:基于HSI模型和量子傅里叶变换的单通道量子彩色图像加密算法(2018)
  18. 多功能阿兹哈米德酶抑制剂;阿兹哈姆-阿齐德多功能抑制剂;阿兹哈姆-阿齐德多功能抑制剂;阿兹哈姆-阿齐德-阿齐德多功能药物;阿兹哈姆-阿齐德-阿齐德-阿齐德;阿兹哈姆-阿齐德-阿齐德多功能药物;阿齐姆阿齐德-穆罕默德-阿齐德-阿齐德多功能药物;阿齐亚姆-阿齐德-阿齐德-阿齐德-阿齐德-阿齐德-阿齐德-阿齐德-,分子对接与动态模拟洞察(2018)
  19. Quer,J.;Donati,L.;Keller,B.G.;Weber,M.:反应坐标系下分子动力学的自动自适应重要性采样算法(2018)
  20. 杨建斌;朱冠华;佟、杜都;陆兰元;沈祖伟:基于B样条紧框架的力匹配方法(2018)

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