AFMPB公司

AFMPB:一个用于计算生物分子系统中静电的自适应快速多极Poisson-Boltzmann解算器。描述了一种用于计算生物分子中静电场的自适应快速多极Poisson-Boltzmann求解器。该求解器将快速多极子方法与Krylov子空间方法相结合,用于求解线性化Poisson-Boltzmann方程的条件良好的边界积分方程。数值实验表明,在现有台式机上,在相对大分子的框架下,该方法是有效的。


zbMATH中的参考文献(参考文献10条)

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  1. 吴昊;英,金庸;邹青松:预测离子溶剂中生物分子静电的有限体积元法(2021)
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  6. 张波;彭、博;黄景芳;皮西亚尼斯,尼科斯P。;孙小白;Lu,Benzhou:分子溶剂化自由能计算的自动表面网格并行AFMPB求解器(2015)
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  8. 吕本卓;程小林;黄景芳;McCammon,J.Andrew:AFMPB:用于计算生物分子系统中静电的自适应快速多极泊松-玻尔兹曼解算器(2013)
  9. 张波;黄景芳;皮西亚尼斯,尼科斯P。;孙小白:基于傅立叶级数的核无关快速多极子方法(2011)
  10. 吕本卓;程小林;黄景芳;McCammon,J.Andrew:AFMPB:用于计算生物分子系统中静电的自适应快速多极泊松-玻尔兹曼解算器(2010)