AFMPB公司

AFMPB：一个用于计算生物分子系统中静电的自适应快速多极Poisson-Boltzmann解算器。描述了一种用于计算生物分子中静电场的自适应快速多极Poisson-Boltzmann求解器。该求解器将快速多极子方法与Krylov子空间方法相结合，用于求解线性化Poisson-Boltzmann方程的条件良好的边界积分方程。数值实验表明，在现有台式机上，在相对大分子的框架下，该方法是有效的。

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zbMATH中的参考文献（参考文献10条)

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  1. 吴昊；英，金庸；邹青松：预测离子溶剂中生物分子静电的有限体积元法（2021）
  2. 李娇；英，金庸；Lu，Benzhou:准确预测浸入式生物分子静电场的通量跳跃保持梯度恢复技术（2019）
  3. 泉、朝宇；斯坦姆，本杰明；Maday，Yvon:Poisson-Boltzmann溶剂化模型的区域分解方法（2019）
  4. 张波；德波尔，杰克逊；尼泽尔斯基，德雷克；马约洛，西尔维奥；吕本卓；Sterling，Thomas:分布式存储体系结构上DASHMM加速自适应快速多极泊松玻尔兹曼解算器（2019）
  5. 谢德轩：求解非均匀离子尺寸修正Poisson-Boltzmann方程的新有限元迭代法（2017）
  6. 张波；彭、博；黄景芳；皮西亚尼斯，尼科斯P。；孙小白；Lu，Benzhou:分子溶剂化自由能计算的自动表面网格并行AFMPB求解器（2015）
  7. 耿卫华；Krasny，Robert:溶剂化生物分子静电学的treecode加速边界积分Poisson-Boltzmann解算器（2013）
  8. 吕本卓；程小林；黄景芳；McCammon，J.Andrew:AFMPB:用于计算生物分子系统中静电的自适应快速多极泊松-玻尔兹曼解算器（2013）
  9. 张波；黄景芳；皮西亚尼斯，尼科斯P。；孙小白：基于傅立叶级数的核无关快速多极子方法（2011）
  10. 吕本卓；程小林；黄景芳；McCammon，J.Andrew:AFMPB:用于计算生物分子系统中静电的自适应快速多极泊松-玻尔兹曼解算器（2010）