浦东新区

PSD-95、Dlg和ZO-1/2中存在域。
浦东新区
SMART登录号:SM00228型
描述: 也称为DHR(Dlg同源区)或GLGF(这些结构域中相对保守的四肽)。一些PDZ已被证明能结合C末端多肽;另一些似乎结合内部(非C末端)多肽。不同的PDZ具有不同的结合特性。
解释摘要(IPR001478型):

PDZ结构域(也称为Discs-大同源区(DHR)或GLGF)存在于细菌、酵母、植物、昆虫和脊椎动物的多种信号蛋白中[(出版日期:9041651) (出版日期:9204764) ]. PDZ结构域可以出现在一个或多个拷贝中,并且几乎总是在细胞质蛋白中发现。它们结合蛋白质的羧基末端序列或内部肽序列[(出版日期:9204764) ]. 在大多数情况下,PDZ结构域与其靶标之间的相互作用是结构性的,结合亲和力为1至10微米。然而,有时需要激活细胞表面受体的激动剂依赖性来促进与PDZ蛋白的相互作用。PDZ结构域蛋白通常与质膜相关,质膜是高浓度磷脂酰肌醇4,5-二磷酸(PIP2)的所在区域。PIP2与Ⅱ类PDZ结构域子集(syntenin、CASK、Tiam-1)之间的直接相互作用已被证明。

PDZ结构域由80到90个氨基酸组成,包括六条β链(β-A到β-F)和两个α-亲缘体A和B,紧密排列成球状结构。配体的肽结合发生在细长的表面凹槽中,因为反平行的β链与β-B链和B螺旋相互作用。PDZ结构域的结构允许通过β-a和β-B链之间的羧酸结合环与肽末端的游离羧酸基团结合。

GO功能:蛋白质结合(去:0005515)
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333040224949个蛋白质中的PDZ结构域SMART的nrdb数据库。

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