PDBsum条目3周

水解酶

PDB id

3周

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			蛋白质链

					公元176年。


					公元216年。


					公元215年。


					公元194年。

			水域 ×387

PDB id：

3周

链接

姓名：

水解酶

标题：

aeolicus含水层rsep同源物周质pdz串联片段与fab片段复合物

结构：

推测锌金属蛋白酶aq_1964。链：a，b.片段：pdz串联片段，unp残基115-292。工程设计：是的。小鼠igg1-kappa fab（重链）。链：h，i.小鼠igg1-kappa fab（轻链）。链条：l，m

资料来源：

Aquifex aeolicus公司。生物体_出租车：224324。应变：vf5。基因：aq_1964。表达单位：大肠杆菌。表达式系统最大值：562。小肌肉。有机体_出租车：10090。有机体_出租车：10090

分辨率：

2.20Å

R系数：

0.227

无R：

0.272

作者：

T.Nogi、S.Tabata、K.Tamura-Kawakami、J.Takagi

密钥参考：

Y.Hizukuri先生等。(2014).膜内分离蛋白酶RseP中非经典PDZ串联的基于结构的底物识别模型。结构,22,326-336.PubMed编号：24389025 内政部：2016年10月10日/j.str.2013.12.003

日期：

2013年10月28日

发布日期：

2013年12月18日

PROCHECK检查

	标题

	工具书类

蛋白质链

^?

O67776号 （Y1964_合格）-风叶Aquifex aeolicus（菌株VF5）的推定锌金属蛋白酶aq_1964

序号：
结构：公元429年。
公元176年。

蛋白质链

此链没有UniProt id

结构：公元216年。

蛋白质链

此链没有UniProt id

结构：公元215年。

蛋白质链

此链没有UniProt id

结构：公元194年。

密钥： PfamA域二级结构 CATH域



		酶反应

酶类：

链条A、B： E.C.3.4.24- -？？？？？

[国际酶] [ExPASy] [KEGG]（KEGG）【布伦达】

DOI编号：2016年10月10日/j.str.2013.12.003 结构 22:326-336(2014)

PubMed编号：24389025

膜内分离蛋白酶RseP中非经典PDZ串联的基于结构的底物识别模型。

Y.Hizukuri， T.奥达， S.Tabata， K.Tamura-Kawakami， R.Oi，佐藤先生， J.Takagi，秋山Y.Akiyama， T.诺吉。

摘要

在大肠杆菌胞质外应激反应期间膜内蛋白酶RseP仅在膜锚定蛋白酶DegS截断RseA的周质部分抑制RseP的作用。这里我们分析了三维结构存在两个串联排列的PSD-95/Dlg/ZO-1（PDZ）域（PDZ串联）在RseP的周质区，发现两个推测的配体结合槽构成一个单一的口袋状结构就在隔离在膜内的活性中心上方。完全移除来自RseP的PDZ串联导致RseA的膜内裂解通过DegS预先截断。此外，突变预计会破坏PDZ串联的三级结构也导致了对顺序解理。这些观察结果表明，PDZ串联作为size-exclusion过滤器，用于将截断形式的RseA容纳到活动中心。