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PDBsum条目2m0v
转至PDB代码:
蛋白质结合/蛋白质结合
PDB id
200伏
加载。。。
目录
蛋白质
链
公元128年。
配体
GLN-ASP-THR-ARG(GLN-ASP-THR-ARG)-
亮
PDB id:
200伏
链接
PDBe公司
雷达散射截面
MMDB公司
耶拿图书馆
蛋白质体
CATH公司
SCOP公司
PDBSWS公司
ProSAT项目
姓名:
蛋白质结合/蛋白质结合
标题:
nherf1的c-末端cftr肽和扩展pdz2结构域的复合结构
结构:
钠(+)/h(+)交换调节辅因子nhe-rf1。
链:a.片段:pdz2域。
同义词:nherf-1、ezrin-radixin-moesin-binding磷蛋白50、ebp50、na(+)/h(+)交换器的调节辅因子、钠氢交换器调节因子1、溶质载体家族9亚型a3调节因子1。
工程设计:是的。
C-末端cftr肽。
资料来源:
智人。
人类。
有机体_出租车:9606。
基因:slc9a3r1,nherf,nherf1。
表达单位:大肠杆菌。
表达式系统最大值:562。
合成:是
核磁共振结构:
20种型号
作者:
S.Bhattacharya、J.H.Ju、D.Cowburn、Z.Bu
密钥参考:
S.巴塔查里亚
等。
(2013).
配体诱导了NHERF1延伸PDZ结构域的动态变化。
分子生物学杂志
,
425
,
2509-2528.
PubMed编号:
23583913
内政部:
2016年10月10日/j.jmb.2013.04.01
日期:
2012年11月6日
发布日期:
2013年4月24日
PROCHECK检查
标题
工具书类
蛋白质链
?
第14745页
(NHRF1_人类)-
智人Na(+)/H(+)交换调节辅因子NHE-RF1
序号:
结构:
公元358年。
公元128年。
*
密钥:
PfamA域
二级结构
CATH域
*
PDB和UniProt序列不同
7个残留位置(黑色
十字架)
酶反应
酶类:
电气控制。?
[国际酶]
[ExPASy]
[KEGG](KEGG)
【布伦达】
DOI编号:
2016年10月10日/j.jmb.2013.04.01
分子生物学杂志
425
:2509-2528
(2013)
PubMed编号:
23583913
配体诱导NHERF1延伸PDZ结构域的动态变化。
S.Bhattacharya,
朱建华,
N.奥尔洛瓦,
J.A.Khajeh,
D.考本,
Z.Bu.公司。
摘要
多域支架蛋白NHERF1调节组装和
各种跨膜受体的细胞内转运和离子转运
蛋白质。
两个PDZ(突触后密度95/盘大/小带闭塞1)
NHERF1的结构域具有非常不同的配体结合能力:PDZ1
识别多种具有高亲和力的膜蛋白,而PDZ2仅
结合有限数量的靶蛋白。
在这里使用NMR,我们已经确定了
区分
羧基中1型PDZ结合基序(QDTRL)的两个PDZ结构域
囊性纤维化跨膜调节因子的终点。
与PDZ2类似,我们有
确定了一个耦合到规范PDZ1域的螺旋-环-螺旋子域。
扩展的PDZ1域具有高度的灵活性,在
快速和缓慢的时间尺度,而扩展的PDZ2域是相对刚性的。
扩展PDZ1结构的延展性有助于
配体结合位点到远端螺旋-环-螺旋的构象变化
扩展。
相比之下,配体结合对
扩展PDZ2结构域的构象和动力学。
研究表明
配体诱导的结构和动力学变化与
假定的PDZ结合位点决定了配体的选择性和结合亲和力
NHERF1的两个PDZ结构域。
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