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PDBsum条目2m0v

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蛋白质 配体 链接
蛋白质结合/蛋白质结合 PDB id
200伏

 

 

 

 

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JSmol公司 PyMol公司  
目录
蛋白质
公元128年。
配体
GLN-ASP-THR-ARG(GLN-ASP-THR-ARG)-
PDB id:
200伏
姓名: 蛋白质结合/蛋白质结合
标题: nherf1的c-末端cftr肽和扩展pdz2结构域的复合结构
结构: 钠(+)/h(+)交换调节辅因子nhe-rf1。链:a.片段:pdz2域。同义词:nherf-1、ezrin-radixin-moesin-binding磷蛋白50、ebp50、na(+)/h(+)交换器的调节辅因子、钠氢交换器调节因子1、溶质载体家族9亚型a3调节因子1。工程设计:是的。C-末端cftr肽。
资料来源: 智人。人类。有机体_出租车:9606。基因:slc9a3r1,nherf,nherf1。表达单位:大肠杆菌。表达式系统最大值:562。合成:是
核磁共振结构: 20种型号
作者: S.Bhattacharya、J.H.Ju、D.Cowburn、Z.Bu
密钥参考: S.巴塔查里亚等。(2013).配体诱导了NHERF1延伸PDZ结构域的动态变化。分子生物学杂志,425,2509-2528.PubMed编号:23583913 内政部:2016年10月10日/j.jmb.2013.04.01
日期:
2012年11月6日 发布日期:   2013年4月24日
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 标题
 工具书类

蛋白质链
Pfam公司   架构模式 ?
第14745页 (NHRF1_人类)-智人Na(+)/H(+)交换调节辅因子NHE-RF1
序号:
结构:
公元358年。
公元128年。*
密钥: PfamA域 二级结构 CATH域
* PDB和UniProt序列不同7个残留位置(黑色十字架)

酶反应
酶类: 电气控制。?
[国际酶] [ExPASy] [KEGG](KEGG) 【布伦达】

 

 
DOI编号:2016年10月10日/j.jmb.2013.04.01 分子生物学杂志 425:2509-2528(2013)
PubMed编号:23583913  
 
 
配体诱导NHERF1延伸PDZ结构域的动态变化。
S.Bhattacharya, 朱建华, N.奥尔洛瓦, J.A.Khajeh, D.考本, Z.Bu.公司。
 
  摘要  
 
多域支架蛋白NHERF1调节组装和各种跨膜受体的细胞内转运和离子转运蛋白质。两个PDZ(突触后密度95/盘大/小带闭塞1)NHERF1的结构域具有非常不同的配体结合能力:PDZ1识别多种具有高亲和力的膜蛋白,而PDZ2仅结合有限数量的靶蛋白。在这里使用NMR,我们已经确定了区分羧基中1型PDZ结合基序(QDTRL)的两个PDZ结构域囊性纤维化跨膜调节因子的终点。与PDZ2类似,我们有确定了一个耦合到规范PDZ1域的螺旋-环-螺旋子域。扩展的PDZ1域具有高度的灵活性,在快速和缓慢的时间尺度,而扩展的PDZ2域是相对刚性的。扩展PDZ1结构的延展性有助于配体结合位点到远端螺旋-环-螺旋的构象变化扩展。相比之下,配体结合对扩展PDZ2结构域的构象和动力学。研究表明配体诱导的结构和动力学变化与假定的PDZ结合位点决定了配体的选择性和结合亲和力NHERF1的两个PDZ结构域。
 

 

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