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PDBsum条目1w9q

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蛋白质 配体 蛋白质-蛋白质界面 链接
细胞粘附 PDB id
1周9次

 

 

 

 

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JSmol公司 PyMol公司  
目录
蛋白质
公元163年。 *
配体
ASN-GLU-PHE-ALA公司-
PHE公司
BEZ公司
水域 ×370
*残留物保存分析
PDB id:
1周9次
姓名: 细胞粘附
标题: 人syntenin与tnefaf肽复合物中pdz串联的晶体结构
结构: Syntenin 1。链:a,b.片段:pdz串联,残基113-273。同义词:syndecan结合蛋白1、黑色素瘤分化相关蛋白9、mda-9、支架蛋白pbp1、pro-tgf-alpha、细胞质域相互作用蛋白18、tacip18。工程设计:是的。Tnefaf肽。链条:s。
资料来源: 智人。人类。有机体_出租车:9606。基因:sdcbp或mda9或sycl。表达单位:大肠杆菌。表达式_system_taxid:511693。合成:是的。合成构造。有机体_出租车:32630
分辨率:
1.70Å     R系数:   0.176 无R:   0.224
作者: J.Grembecka、T.Cierpicki、Y.Devedjiev、D.R.Cooper、Z.S.Derewenda
密钥参考:
J.格雷姆贝卡等。(2006).合成蛋白的PDZ串联与靶蛋白的结合。生物化学,45,3674-3683.PubMed编号:16533050 内政部:10.1021/bi052225y
日期:
2004年10月15日 发布日期:   2006年3月22日
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 标题
 工具书类

蛋白质链
Pfam公司   架构模式 ?
O00560号 (SDCB1_人类)-智人合成蛋白-1
序号:
结构:
公元298年。
公元163年。*
密钥: PfamA域 二级结构 CATH域
* PDB和UniProt序列不同2个残留位置(黑色十字架)

酶反应
酶类: 电气控制。?
[国际酶] [ExPASy] [KEGG](KEGG) 【布伦达】

 

 
DOI编号:10.1021/bi052225y 生物化学 45:3674-3683(2006)
PubMed编号:16533050  
 
 
合成蛋白PDZ串联与靶蛋白的结合。
J.Grembecka, T.西尔皮基, Y.Devedjiev, U.Derewenda, B.S.康, J.H.布什韦勒, Z.S.德雷温达。
 
  摘要  
 
PDZ结构域是已知基因组中最丰富的蛋白质模块之一。其主要功能是为膜相关蛋白提供支架通过与受体的胞浆C末端片段结合形成复合物,通道和其他完整的膜蛋白。这里,使用两个异核核磁共振和单晶X射线衍射,我们展示了不同肽序列,包括与syndecan、neurexin、,和肾上腺素B,可以同时结合到支架的两个PDZ域蛋白质合成素。PDZ2结构域以规范的方式结合这些肽,并且诱导配合机构允许调节一定范围的侧面链条处于P(0)和P(-)(2)位置。但是,绑定到PDZ1域要求目标肽具有非标准构象。这些数据帮助解释syntenin和其他可能含有PDZ的蛋白质优先结合二聚体和聚集靶点,并提供一种机制对先前报道的syntenin协同配体结合的解释两个PDZ域。
 

引用此PDB文件关键参考的文献参考

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