PDB总和条目4k78

肽结合蛋白/蛋白质结合

PDB id

4千78

加载。。。

			蛋白质链

					公元87年。

			配体

					ALA-ASN-SER-ARG公司- TRP-GLN-ASP-THR- ARG-LEU公司

			水域 ×69

PDB id：

4千78

链接

姓名：

肽结合蛋白/蛋白结合

标题：

Cftr相关配体（cal）e317a-pdz结构域与肽ical36-qtrl结合（ansrwqtrl）

结构：

高尔基体相关的pdz和线圈-线圈基序蛋白。链：a.片段：pdz域。同义词：cftr相关配体，在胶质母细胞瘤中融合，pdz蛋白与tc10特异性相互作用，pist。工程设计：是的。突变：是的。Ical36-qdtrl肽。

资料来源：

智人。人类。有机体_出租车：9606。基因：gopc，cal，figure表达于：大肠杆菌。表达式_系统_最大值：469008。合成：是

分辨率：

1.80Å

R系数：

0.185

无R：

0.221

作者：

J.F.Amacher、D.R.Madden

密钥参考：

J.F.阿马赫等。(2014).立体化学偏好调节结合CFTR的五个PDZ结构域之间的亲和力和选择性：比较结构和序列分析。结构,22,82-93.PubMed编号：24210758 内政部：2016年10月10日/j.str.2013.09.019

日期：

2013年4月16日

发布日期：

2014年1月22日

PROCHECK检查

	标题

	工具书类

蛋白质链

^?

Q9HD26型 （GOPC_HUMAN）-智人高尔基体相关PDZ和线圈基序蛋白

序号：
结构：公元462年。
公元87年。*

密钥： PfamA域二级结构 CATH域

* PDB和UniProt序列不同2个残留位置（黑色十字架）

DOI编号：2016年10月10日/j.str.2013.09.019 结构 22:82-93(2014)

PubMed编号：24210758

立体化学偏好调节结合CFTR的五个PDZ结构域之间的亲和力和选择性：比较结构和序列分析。

J.F.阿马赫， P.R.库欣， L.Brooks， P.Boisguerin， D.R.马登。

摘要

PDZ域相互作用涉及信号传递和贩运途径协调关键的细胞过程。基于对齐的PDZ绑定图案在肽的某些位置确定少数最有利的残基骨干。然而，结合CAL（CFTR相关配体）PDZ的序列域只揭示了一个退化的基序，它过度预测了高亲和力相互作用物。在这里，我们结合了扩展的肽阵列基序用生化技术分析表明，非基序“调制器”残基影响CAL结合。结晶学13个CAL的结构：肽复合物显示出明确但可调节的非基序位置的立体化学环境，反映在多序列替代阵列所揭示的调制器偏好。这些偏好有助于识别高亲和力CAL结合序列和差异影响CAL和NHERF PDZ结合。因此，它们也有帮助确定管制贩运的PDZ域网络的特殊性CFTR在心尖膜的表达。