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蛋白质结合

PDB id

400万

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			蛋白质链

					公元91年。

			配体

					ACY公司

			金属

					_CL公司

			水域×129

PDB id：

400万

链接

姓名：

蛋白质结合

标题：

p21空间群中nherf1-pdz1结构域与cxcr2 c端尾络合的晶体结构

结构：

钠（+）/h（+）交换调节辅因子nhe-rf1。链：a.片段：unp残基11-95。工程设计：是

资料来源：

智人。人类。有机体_出租车：9606。基因：nherf，nherf1，slc9a3r1。表达单位：大肠杆菌。表达式_系统_最大值：469008。

分辨率：

1.10Å

R系数：

0.190

无R：

0.217

作者：

Y.Jiang、G.Lu、Y.Wu、J.Brunzelle、N.Sirinupong、C.Li、Z.Yang

密钥参考：

Y.Jiang（江）等。(2013).晶格捕获NHERF1-CXCR2信号复合物的新构象状态。公共科学图书馆期刊,8,e81904。PubMed编号：24339979 内政部：10.1371/日记本.0081904

日期：

2013年7月10日

发布日期：

2014年1月15日

PROCHECK检查

	标题

	工具书类

蛋白质链

^?

第14745页 （NHRF1_人类）-智人Na（+）/H（+）交换调节辅因子NHE-RF1

序号：
结构：公元358年。
公元91年。*

密钥： PfamA域二级结构 CATH域

* PDB和UniProt序列不同在5个残留位置（黑色十字架）



		酶反应

酶类：

电气控制。？

[国际酶] [ExPASy] [KEGG]（KEGG）【布伦达】

DOI编号：10.1371/日记本.0081904 公共科学图书馆期刊 8：e81904(2013)

PubMed编号：24339979

通过晶格陷阱捕获NHERF1-CXCR2信号复合物的新构象状态。

姜瑜， G.Lu， L.R.特雷斯科特，侯耀文， X.Guan、， S.Wang， A.斯塔门科维奇， J.Brunzelle， N.Sirinupong， C.李， Z.杨。

摘要

NHERF1是一种PDZ衔接蛋白，支持多种信号的组装并与许多癌症有关。然而，人们知之甚少关于脚手架混乱或其能力的机制绑定到多个目标。计算研究表明，PDZ混杂可能归因于其构象动力学，但实验这种关系的证据仍然非常有限。在这里，我们检查利用晶格研究NHERF1 PDZ1畴的构象柔性通过求解新晶体形式的PDZ1结构进行捕获，与不同空间群的先前PDZ1结构一起揭示了411个配体相互作用残基中有11个发生了显著的晶体堆积诱导结构变化。这些残留物大多与所涉及的残留物相对应肽配体结合时的变构转变。此外配体构象的差异导致同一肽轻微结合不同晶体形式的不同模式。这些发现表明PDZ1多肽结合具有显著的结构灵活性袋，并且捕获在当前晶体形式中的结构亚态可以是用于表示蛋白质可访问的构象空间。这样的知识对于针对NHERF1 PDZ1结构域的药物设计至关重要，强调对实验测定的PDZ1-l和复合物。