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膜蛋白 PDB id
1佐克

 

 

 

 

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JSmol公司 PyMol公司  
目录
蛋白质
公元93年。 *
*残留物保存分析
PDB id:
1佐克
姓名: 膜蛋白
标题: 突触相关蛋白97的Pdz1结构域
结构: 突触前蛋白sap97。链:a.片段:pdz1结构域(残基221-313)。同义词:突触相关蛋白97,sap-97,盘,大同源物1。工程设计:是
资料来源: 褐家鼠。挪威老鼠。生物体_出租车:10116。表达单位:大肠杆菌。表达式系统最大值:562
核磁共振结构: 1个型号
作者: L.Wang、A.Piserchio、D.F.Mierke
密钥参考:
L·王等。(2005).突触相关蛋白97与N-甲基-D-天冬氨酸受体NR2B亚基分子间相互作用的结构表征。生物化学杂志,280,26992-26996.PubMed编号:15929985 内政部:10.1074/jbc。M503555200型
日期:
2005年5月13日 发布日期:   2005年6月7日
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 标题
 工具书类

蛋白质链
Pfam公司   架构模式 ?
问题62696 (DLG1_RAT)-褐家鼠圆盘大同源物1
序号:
结构:
 
序号:
结构:
公元911年。
公元93年。
密钥: PfamA域 二次结构 CATH域

酶反应
酶类: 电气控制。?
[国际酶] [ExPASy] [KEGG](KEGG) 【布伦达】

 

 
DOI编号:10.1074/jbc。M503555200型 生物化学杂志 280:26992-26996(2005)
PubMed编号:15929985  
 
 
突触相关蛋白-97与N-甲基-D-天冬氨酸受体NR2B亚单位分子间相互作用的结构表征。
L.Wang, A.皮塞尔奇奥, D.F.米尔克。
 
  摘要  
 
突触相关蛋白-97(SAP97)在正常贩运中很重要N-甲基-D-天冬氨酸离子型谷氨酸的细胞表面维护受体。分子支架/受体相互作用由N-甲基-D-天冬氨酸NR2B亚基C末端的结合受体与SAP97的PDZ结构域。这里,我们描述了NR2B的C末端与SAP97的PDZ结构域结合,并确定其结构PDZ1-NR2B复合物采用高分辨率核磁共振。基于荧光各向异性,NR2B亚单位与SAP97的第一和第二PDZ结构域结合,对PDZ2的亲和力较高;无法测量PDZ3的明显结合。与PDZ1结合的NR2B的结构特征与C的-3位谷氨酸的典型PDZ结合基序终端(即e-S-D-V)与beta2/beta3环路相互作用。内的两个站点PDZ1的环被PDZ2、D243G的相应残基替换和P245Q。前一种突变旨在消除可能的库仑效应E(-3)(NR2B)和Asp-243(PDZ1)之间的斥力对结合。P245Q突变导致结合亲和力增加2倍NR2B,接近野生型PDZ2的观察值。这些结果表明beta2/beta3环路的改造为调节PDZ结构域的配体特异性。
 
  所选图形  
 
图3。
图3。PDZ1化学位移的扰动NR2B C末端结合后的SAP97域NMDA受体亚单位。
图4。
图4。基于荧光各向异性的结合曲线NR2B(---)和Kv1.4的C末端肽(···)到PDZ1(a)和PDZ2(b)SAP97的域。PDZ1的K[D]为9.7µMNR2B和Kv1.4,PDZ2的K[D]分别为1.3和1.7NR2B和Kv1.4分别为µM。
 
  以上数字为重印经ASBMB许可:生物化学杂志(2005,280,26992-26996)版权所有2005。  
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引用此PDB文件关键参考的文献参考

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海兔突触相关蛋白(APSAP):鉴定、表征和与Shaker-type钾通道的选择性相互作用。
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哺乳动物神经元蛋白PSD-95第三个PDZ结构域(PDZ3)的热力学配体结合研究。
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