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图表

graph:处理图形数据结构的包


生物导体版本:释放(3.19)

实现一些简单图形处理功能的包。

作者:R Gentleman[aut]、Elizabeth Whalen[aut]、W Huber[aut)、S Falcon[aut】、Jeff Gentry[aut’、Paul Shannon[aut'、Halimat C.Atanda[ctb](从Sweave转换为RMarkdown/HTML的‘MultiGraphClass’和‘GraphClass'渐晕图)、Paul-Villafuerte[ctb][从Sweav转换为RMarkdown/HTML的渐晕图]、Aliyu Atiku Mustapha[ctb'(将“图形”渐晕图从Sweave转换为RMarkdown/HTML。),Bioconductor Package Maintainer[创建]

维护人员:生物导体包维护者<Bioconductor.org上的维护者>

引文(从R中输入引文(“图表”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“图形”)

对于旧版本的R,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“图形”)
图形对象的属性 HTML格式 R脚本
clusterGraph和distGraph HTML格式 R脚本
图形设计 HTML格式 R脚本
graphBAM和MultiGraph类 HTML格式 R脚本
如何使用图形包 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式

细节

生物视图 图形和网络,软件
版本 1.82.0
在生物导体中 BioC 1.6(R-2.1)或更早(>19年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=2.10),方法,生物遗传学(>= 0.13.11)
进口 stats、stats4、utils
系统要求
统一资源定位地址
查看更多
建议 SparseM(备用)(>= 0.36),XML格式,苏格兰皇家银行,RUnit(运行单位),集群,仿生风格,针织物
链接到
增强功能 Rgraphviz公司
取决于我 ap复合物,生物图像,BioMVC类,生物网络,BLMA公司,蜂窝NOptR,剪刀,CNOR馈线,扩展浏览器,GOstats公司,图形AT,GSEA基地,超图,MineICA公司,路径渲染,Pigengene公司,RbcBook1(笔记本1),苏格兰皇家银行,RBioinf公司,RCyjs公司,Rgraphviz公司,ROntoTools(机器人工具),SRAdb公司,topGO(顶GO),vtpnet(vtpnet),DLBCL(DLBCL),国民账户体系数据,酵母实验数据,cyj闪亮,dlsem公司,网格Graphviz,GUIProfiler(GUIProfiller),哈斯图表,巴黎维兹,PerfMeas公司,子路径LNCE
导入我 注释中心数据,BgeeDB公司,生物检测,BiocFHIR公司,生物图谱,生物OncoTK,生物包装工具,生物视图,bnem公司,摄像机,类别,类别比较,奇姆拉维兹,ChIPpeakAnno公司,CHRONOS公司,康西卡,细胞ML,dce公司,DEG图,DEsubs公司,epiNEM公司,事件指针,fgga公司,flowClust(流动俱乐部),流工作区,量规,通用网络构建器,基因组相互作用节点,图形AT,石墨,超绘图,KEG图形,骨形态学,MIRit公司,记忆,NCI图表,网络响应,肿瘤模拟R,个体过程,奥索姆,有机体Dbi,路径视图,PhenStat公司,普华永道,qp图,RCy3号机组,RGraph2js公司,皇家海军陆战队,Rtremix公司,拼接图,彩色纸带,变量筛选,BioPlex公司,澳大利亚银行,贝叶斯NetBP,BCDAG公司,BiDAG公司,BNrich公司,ceg公司,CePa公司,classGraph类,clustNet(群集网络),代码依赖项,坐标映射器,欧拉语系的,全球黄金市场,网格调试,老人牌汽车,kpcalg(千帕),净4pg,netgsa公司,NetPreProc公司,pcalg公司,pcgen(多氯联苯),破布2脊,等级,RCPA公司,rsolr公司,r光谱,SEM图表,stablespec公司,拓扑GSA,tpc公司,统一DAG,zenplots公司
建议我 注释Dbi,DAPAR公司,DEG图,EB共挤,生态石,格瓦斯卡特,KEG林肯,MLP公司,NetPathMiner公司,rBiopaxParser公司,RCX公司,rTRM公司,S4载体,上海浦东国际机场,变量工具,阿鲁莱斯维兹,bn学习,bnstruct结构,bsub公司,乔尔,epoc公司,gbutils公司,通用网络,gMCP公司,记录仪,熔岩,潜鸟,maGUI(主图形用户界面),心理,rEMM公司,r首选项,剑麻,文本绘图,潮汐记录仪
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 图_1.82.0.tar.gz
Windows二进制 graph_1.82.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 图_1.82.0.tgz
macOS二进制(arm64) 图_1.82.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/graph
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/图形
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/graph/
包短Url https://bioconductor.org/packages/graph/
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