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注释中心数据

将公共数据资源转换为生物导体数据结构


生物导体版本:释放(3.18)

这些配方将种类繁多且数量不断增加的公共生物信息数据集转换为易于使用的标准生物导体数据结构。

作者:马丁·摩根、马克·卡尔森、丹·特南鲍姆、索纳利·阿罗拉、保罗·香农、洛丽·谢泼德、生物导体组件维护者

维护人员:生物导体包维护者<Bioconductor.org上的维护者>

引文(从R中输入引文(“AnnotationHubData”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“AnnotationHubData”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“注释中心数据”)
AnnotationHubData简介 HTML格式
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 数据导入,软件
版本 1.32.1
在生物导体中 生物技术3.2(R-3.2)(8.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=3.2.2),方法,实用程序,S4载体(>= 0.7.21),I范围(>= 2.3.23),基因组范围,批注中心(>= 2.15.15)
进口 基因组特征,Rsamtools软件,rtracklayer公司,生物遗传学,jsonlite,生物管理器,生物视图,生物检测,图表,注释Dbi,博科生物,生物串、DBI、,基因组信息Db(>= 1.15.4),有机体Dbi,RSQLite,注释锻造,futile.logger(>=1.3.0),XML,RCurl
系统要求
统一资源定位地址
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建议 RUnit、knitr、,仿生风格,抓地力2db,基因组信息数据库数据、rmarkdown、,HubPub公司
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取决于我 实验中心数据
导入我 AHEnsDbs公司,AHMassBank公司,欧洲路径数据库
建议我 基因组状态,中心酒吧,吸烟老鼠
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 注释HubData_1.32.1.tar.gz
Windows二进制 注释HubData_1.32.1.zip
macOS二进制(x86_64) 注释轮毂数据_1.32.1.tgz
macOS二进制(arm64) 注释轮毂数据_1.32.1.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AnnotationHubData网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:程序包/AnnotationHubData
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/AnnotationHubData网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/AnnotationHubData网站/
软件包下载报告 下载统计信息
BioC 3.18的旧源程序包 源档案