剪刀
利用路径拓扑的基因集分析
生物导体版本：释放（3.18）
使用两步经验方法实现拓扑基因集分析。它利用图分解理论创建连接树并重构最相关的信号路径。在第一步中，裁剪器根据路径拓扑图的平均值和浓度矩阵的统计测试来选择重要路径。然后，它“剪辑”整个通路，识别与特定表型关联最大的信号通路。
作者：Paolo Martini<Paolo.cavei at gmail.com>，Gabriele Sales<Gabriele.Sales at unipd.it>，Chiara Romualdi<Chiara.Romualdi at unipd.it>
维护人员：保罗·马蒂尼（Paolo.cavei at gmail.com>）
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“剪辑器”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
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浏览幻影（“剪辑器”）
细节
| 生物视图 |
软件 |
| 版本 |
1.42.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术2.12（R-3.0）（11年） |
| 许可证 |
AGPL-3型 |
| 取决于 |
R（>=2.15.0），矩阵，图表 |
| 进口 |
方法，博科生物，Rcpp，igraph，gRbase（>=1.6.6），qp图,KEG图形，公司 |
| 系统要求 |
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| 统一资源定位地址 |
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程序包档案
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