多重分析实验

生物导体中多组学实验集成软件

生物导体版本：释放（3.19）

协调对重叠样本集执行的多个实验分析的数据管理。它扩展了SummarizedExperiment的概念，支持单个分析的标准数据类的开放式混合，并允许按基因组范围或行名称进行细分，从而提供了熟悉的Bioconductor用户体验。提供了将数据重塑为宽格式和长格式的工具，以适应绘图和下游分析。

作者：马塞尔·拉莫斯[aut，cre]、马丁·摩根[aut，ctb]、洛丽·谢泼德[ctb]，埃尔维·帕格斯[ctb'、文森特·凯里[aut

维护人员：马塞尔·拉莫斯<Marcel.Ramos at roswellpark.org>

引文（从R中输入引文（“多重分析实验”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“MultiAssayExperiment”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“多重分析实验”）

多分析实验的协调分析	HTML格式	R脚本
HDF5阵列和多重分析实验	HTML格式	R脚本
多重分析实验_热量表.pdf	PDF格式
快速入门指南	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本
MultiAssayExperiment演示	视频
马塞尔·拉莫斯（Marcel Ramos），研讨会200：多重分析实验和策划TCGAData Bioconductor 2020研讨会	视频

生物视图	数据表示,基础设施,软件
版本	1.30.2
自	生物柴油3.4（R-3.3）（7.5年）
许可证	艺术-2.0
取决于	总结性实验（>=1.3.81），R（>=3.5.0）
进口	博科生物,BiocBaseUtils公司,生物遗传学,DelayedArray（延迟阵列）,基因组学范围,I范围、方法、，S4载体、tidyr、utils
系统要求
统一资源定位地址	http://waldronlab.io/MultiAssay实验/
错误报告	https://github.com/waldronlab/MultiAssayExperiment/issues网站

建议	仿生风格,HDF5阵列、knitr、，黑手党、R.rsp、，Ragged实验、重塑2、rmarkdown、生存、survminer、testtat、UpSetR
链接到
增强功能
取决于我	雪花石膏.mae,CAGEr公司,cBioPortalData公司,类别R,管理PCaData,管理的TCGA数据,评估R,希帕提亚,InTAD公司,MGnifyR公司,米娅,微生物数据集,米达斯HLA,MIRit公司,错误行数,OMICsPCA数据,Q功能,scMultiome公司,单细胞多模式,terraTCGA数据,蒂米尔根
导入我	AffiXcan公司,阿马雷托,微生物,自治,生物点火器,核心Gx,畜栏,管理的TBData,ELMER公司,结果IT2,火焰,gDR核心,gDR导入,gDRutils公司,gINTomics公司,glmSparseNet公司,GOpro公司,爱马仕,HMP2数据,链接HD,代谢组学工作台,MetaScope（元作用域）,MOMA公司,msqrob2,多数据,MultiBaC公司,多模式实验,净Dx,尼帕尔斯MCIA,OMICsPCA公司,omics打印,帕德玛,PDATK（掌上电脑）,药物Gx,物象,ropls公司,供应链计划,sc管道,TCGAutils公司,TCGA工作流,vsclust公司,x芯
建议我	生物OncoTK,brge数据,CNV愤怒,黑手党,财政部2,MOFAdata公司,多数据集,Ragged实验,更新对象
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	多重分析实验_1.30.2.tar.gz
Windows二进制	多重分析实验_1.30.2.zip
macOS二进制（x86_64）	多重分析实验_1.30.2.tgz
macOS二进制（arm64）	多重分析实验_1.30.2.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MultiAssay实验
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/MultiAssayExperiment
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MultiAssay实验/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/MultiAssay实验/
软件包下载报告	下载统计信息
BioC 3.19的旧源程序包	源存档