InTAD公司
TAD表观遗传信号与基因表达的相关性研究
生物导体版本：发布（3.18）
该软件包的重点是检测拓扑相关域（TAD）内或染色质接触环锚定之间表达基因与选定表观基因信号（即从ChIP-seq数据获得的增强子）之间的相关性。可以控制各种参数来研究外部因素的影响，并且每个分析步骤都有可视化绘图。
作者：康斯坦丁·奥科涅奇尼科夫（Konstantin Okonechnikov）、塞拉普·埃克克（Serap Erkek）、卢卡斯·查韦斯（Lukas Chavez）
维护人员：康斯坦丁·奥科涅奇尼科夫（Konstantin Okonechnikov）
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“InTAD”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览渐晕图（“InTAD”）
细节
| 生物视图 |
ChIPSeq公司,表观遗传学,基因表达式,HiC公司,免疫肿瘤学,RNA序列,排序,软件 |
| 版本 |
1.22.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术3.7（R-3.5）（6年） |
| 许可证 |
GPL（>=2） |
| 取决于 |
R（>=3.5），方法，S4矢量,I范围,基因组范围,多分析实验,总结性实验，统计信息 |
| 进口 |
生物遗传学,博科生物,rtracklayer公司，并行，图形，mclust，q值，ggplot2，utils，ggpubr |
| 系统要求 |
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| 统一资源定位地址 |
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查看更多
| 建议 |
测试，仿生风格、knitr、rmarkdown |
| 链接到 |
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| 增强功能 |
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生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
