CNV愤怒
CNV范围的总结和表达/表型关联
生物导体版本：发布（3.18）
CNVRanger包实现了一个用于CNV分析的综合工具套件。这包括总结群体中单个CNV呼叫的功能，评估与功能基因组区域的重叠，以及与基因表达和定量表型的关联分析。
作者：路德维希·盖斯林格[aut，cre]，维尼修斯·亨里克·达席尔瓦[aut]，马塞尔·拉莫斯[ctb]，列维·沃尔德龙[ctb]
维护人员：路德维希·盖斯林格（Ludwig Geistlinger）<Ludwig.Geistlinger at gmail.com>
引文（从R中输入引文（“CNVRanger”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）生物管理器：：安装（“CNVRanger”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“CNVRanger”）
细节
| 生物视图 |
副本编号变化,差异表达式,基因表达式,基因组广泛协会,基因组变异,微阵列,RNA序列,SNP公司,软件 |
| 版本 |
1.18.1 |
| 在生物导体中 |
生物技术3.9（R-3.6）（5年） |
| 许可证 |
艺术-2.0 |
| 取决于 |
基因组范围,Ragged实验 |
| 进口 |
生物遗传学,生物并行,GDS阵列,基因组信息Db,I范围,S4矢量,SNP关联,总结性实验，数据表，边缘R,gdsfmt公司，gr设备，晶格，利马，方法，plyr，qqman，rapdirs，reformate2，stats，utils |
| 系统要求 |
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| 统一资源定位地址 |
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| 错误报告 |
https://github.com/waldronlab/CNVRanger/issues |
查看更多
| 建议 |
批注中心,英国基因组。金牛座。UCSC.bosTau6.屏蔽,生物风格,复杂热图,Gviz公司,多重分析实验,TCG实用程序,TxDb（发送日期）。哈皮恩斯。UCSC.hg19.known基因,管理的TCGA数据,集成数据库、网格、针织，组织Hs.eg.db,区域R、rmarkdown、statmod |
| 链接到 |
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| 增强功能 |
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生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
