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评估R

生物信息学指标评估


生物导体版本:释放(3.18)

通过分析这些指标分类的稳定性和优度,评估您自己的指标和在您自己的数据集上进行的度量的可靠性。

作者:何塞·安东尼奥·贝纳贝-Díaz[aut,cre],曼努埃尔·弗兰科[aut],胡安娜·马里亚·维沃[aut',曼努埃尔·奎萨达·马丁内斯[aut],阿斯特里德·杜克·拉莫斯[aut]Jesualdo Tomás Fernández-Breis[aut

维护人员:何塞·安东尼奥·伯纳贝-迪亚斯<何塞·安东尼奥·伯纳贝1 at um.es>

引文(从R中输入引文(“evalumeR”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“evalumeR”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文件

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“evalumeR”)
用evaloumeR评价生物信息学指标 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 分类,聚类,特征提取,软件
版本 1.18.0
在生物导体中 生物技术3.9(R-3.6)(5年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=3.6),总结性实验,多重分析实验,集群(>=2.0.9),fpc(>=2.2-3),randomForest(>=4.6.14),flexmix(>=2.3.15)
进口 corrplot(>=0.84),grDevices,graphics,reformate2,ggplot2,ggdendro,plotrix,stats,matrixStats,Rdpack,MASS,class,prabclus,mclust,kableExtra
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/neobernad/evaloumeR
错误报告 https://github.com/neobernad/evaloumeR/issues
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建议 仿生风格、knitr、rmarkdown、magrittr
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 评估R_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 评估R_1.18.0.zip
macOS二进制(x86_64) 评估R_1.18.0.tgz
macOS二进制(arm64) 评估R_1.18.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/evaloumeR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/评估R
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/evaloumeR网站/
程序包短Url https://bioductor.org/packages/evaluomeR(https://bioductor.org/packages/evaluomeR)/
软件包下载报告 下载统计信息