生物点火器

从组学数据中发现特征

生物导体版本：释放（3.18）

特征选择在组学数据分析中至关重要，以从复杂和高维数据中提取受限和有意义的分子特征，并建立稳健的分类器。该软件包实现了一种新的方法，用于评估变量对分类器预测性能的相关性。该方法可以与PLS-DA、Random Forest和SVM二进制分类器并行运行。返回签名和相应的“受限”模型，以便对新数据集进行未来预测。该包的Galaxy实现可在Workflow4metabolomics.org计算代谢组学在线基础设施中获得。

作者：菲利普·里诺多[aut]，艾蒂安·塞维诺[aut，cre]

维护人员：Etienne A.Thevenot<Etienne.Thevenot at cea.fr>

引文（从R中输入引文（“biosigner”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“biosigner”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“biosigner”）

生物识别小插曲	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

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细节

生物视图	分类,特征提取,脂质组学,质谱法,代谢组学,蛋白质组学,软件,转录组学
版本	1.30.0
在生物导体中	生物多样性3.3（R-3.3）（8年）
许可证	CeCILL公司
取决于
进口	博科生物、方法、e1071、gr设备、图形、，多重分析实验,多数据集，randomForest，ropls公司，统计，总结性实验，实用程序
系统要求
统一资源定位地址	http://dx.doi.org/10.3389/fmolb.2016.0026

建议	生物标志，生物遗传学,仿生风格,golubEsets公司,胡6800.db、knitr、，省略4rmarkdown测试
链接到
增强功能
取决于我
导入我	多视角
建议我	物象
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	生物信号器_1.30.0.tar.gz
Windows二进制	biosigner_1.30.0.zip文件（仅64位）
macOS二进制（x86_64）	生物识别器_1.30.0.tgz
macOS二进制（arm64）
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biosigner网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/生物签名器
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/biosigner网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/biosigner网站/
软件包下载报告	下载统计信息