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核心Gx

作为其他“Gx”包基础的类和函数


生物导体版本:释放(3.18)

函数和类的集合是我们实验室R包套件的基础,如“PharmaceGx”和“RadioGx”。创建此包是为了从其他实验室包版本中抽象共享功能,以提高可维护性,并减少当前和未来“Gx”套件程序中的代码重复。主要功能包括一个“CoreSet”类,从中派生出“RadioSet”和“PharmaceSet”,以及每个插槽的get和set方法。包括与拟合和绘制剂量反应曲线、量化统计相关性和计算曲线下面积(AUC)或存活率(SF)相关的其他功能。有关更多详细信息,请参阅所附文件,以及:Smirnov,P.、Safikhani,Z.、El-Hachem,N.、Wang,D.、She,A.、Olsen,C.、Freeman,M.、Selby,H.、Gendoo,D.、Grossman,P.,Beck,A.、Aerts,H.,Lupien,M.和Goldenberg,A.(2015).Manem,V.,Labie,M.,Smirnov,P.,Kofia,V.、Freeman,M.、Koritzinksy,M.和Abazeed,M.以及Haibe-Kains,B.和Bratman,S.(2018).

作者:彼得·斯米尔诺夫【aut】、伊恩·史密斯【aut)、克里斯托弗·埃利斯【aut」、李菲菲【aut’、杰米亚·约瑟夫【aut》、本杰明·海贝-凯恩斯【aut,cre】

维护人员:本杰明·海贝-凯恩斯(Benjamin Haibe.Kains)

引文(从R中输入引文(“CoreGx”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“CoreGx”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“CoreGx”)
CoreGx:类和函数抽象 HTML格式 R脚本
治疗反应实验课 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 分类,药物基因组学,软件,生存
版本 2.6.1
在生物导体中 生物C 3.11(R-4.0)(4年)
许可证 GPL(>=3)
取决于 R(>=4.1),生物遗传学,总结性实验
进口 博科生物,S4载体,多重分析实验,矩阵泛型,钢琴,生物并行,平行,凹凸矩阵、checkmate、methods、stats、utils、graphics、grDevices、lsa、data.table、crayon、glue、rlang、bench
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取决于我 药物Gx,收音机Gx,毒物Gx
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 芯Gx_2.6.1.tar.gz
Windows二进制 核心Gx_2.6.1.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 岩芯Gx_2.6.1.tgz
macOS二进制(arm64) 岩芯Gx_2.6.1.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CoreGx
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/CoreGx
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/CoreGx/
包短Url https://bioconductor.org/packages/CoreGx/
软件包下载报告 下载统计信息
BioC 3.18的旧源程序包 源存档