DESeq2公司 swMATH ID: 41938 软件作者: Michael Love、Constantin Ahlmann-Eltze、Kwame Forbes、Simon Anders、Wolfgang Huber 描述: R/Bioconductor软件包DESeq2:基于负二项分布的差异基因表达分析。根据使用负二项分布的模型,估计高通量测序分析中计数数据的方差-相关性,并测试差异表达。引文(从R中输入引文(“DESeq2”):Love MI,Huber W,Anders S(2014)。“利用DESeq2对RNA-seq数据的折叠变化和离散度进行适度估计”,《基因组生物学》,第15550页。doi:10.1186/s13059-014-0550-8。 主页: https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/DESeq2.html 源代码: https://github.com/mikelove/DESeq2 依赖项: 对 相关软件: 生物导体;边缘R;DEseq公司;对;利马;Voom公司;全球气候变化评估;海湾序列;Phyloseq公司;锌波;桅杆;收缩贝叶斯;ZIFA公司;EB序列;卡爪;斯坦;计数;RSEM(RSEM);卢比;REBayes公司 引用于: 47文件 全部的 前5名152位作者引用 三 纳伊姆·拉希德。 2 苏珊·福尔摩斯。 2 约瑟夫·乔治·易卜拉欣 2 尼古拉斯·伊格纳蒂亚迪斯 2 雷,京 2 李洪哲 2 Lin,Kevin Z。 2 凯瑟琳·罗德 2 艾米·威利斯。 1 Akutsu、Tatsuya 1 阿米尔(Amnon Amir) 1 塞缪尔·巴顿 1 毕,冉 1 卞、渊源 1 威廉·比斯卡里 1 伯恩德·比施尔 1 伊丽莎白·博纳菲德 1 安娜·劳尔·伊萨博(Anne-Laure Isabeau),布列斯特(Boulesteix) 1 巴拉克·布里尔 1 佐伊·布罗德 1 伊娃·布丁斯卡 1 曹宏远 1 迈克尔·凯西。 1 陈静香 1 陈军 1 程斌 1 程瑞华 1 程晓青 1 Ching,Wai-Ki(清、外基) 1 布洛克·C·克里斯滕森。 1 奥赞·西纳 1 海伦娜·克劳尔。 1 Siamak Zamani Dadaneh 1 蒂莫西·戴利 1 卡提克·德瓦拉扬 1 丁杰 1 黛安·多诺万(Diane M.Donovan)。 1 妮可·埃伦巴赫 1 阿丹德·贝尔曼(AdandéBelarmain)范多汉(Fandohan) 1 冯、戴 1 朱莉娅·福山 1 拉德·加拉贝赫(Raad Z.Gharaibeh)。 1 德巴希·戈什 1 郭思妮 1 何冲 1 希拉里·黑林。 1 露丝·海勒 1 Anne G.Hoen。 1 萨拉·霍尔特(Sarah E.Holte)。 1 罗马人Hornung 1 伊尔克,奥兹勒姆 1 伊伊贡、杰姆 1 普拉塞帕·杰加纳坦 1 丹尼尔·杰斯克(Daniel R.Jeske)。 1 蒋慧 1 姜若兰 1 克里斯蒂安·乔宾 1 Malene Juul 1 罗曼·格莱莱·卡凯 1 玛格丽特·卡拉加斯。 1 克里斯蒂娜·肯季奥尔斯基 1 康、宗飞 1 简·H·金。 1 基冈·科特豪尔 1 迈克尔·科索罗克。 1 伊库亚·科托卡 1 卡尔·G·库格勒。 1 埃里克·B·拉伯(Eric B.Laber)。 1 Michael T.劳森。 1 Lee,Eva K。 1 詹姆斯·G·勒菲夫尔(James G.Lefevre)。 1 李洪祥 1 李群华 1 李志刚 1 大卫·K·林。 1 林士力 1 林志祥 1 Ling,Wodan女士 1 安德鲁·利西奥 1 刘鹏 1 刘一文 1 刘玉峰 1 丹尼尔·勒基特(Daniel J.Luckett)。 1 吕亚飞 1 马,闪亮 1 马思源 1 马秀玉 1 朱丽叶·C·马丹。 1 托拜厄斯·马德森 1 布莱恩·马丁。 1 马丁斯·格林(Martins-Green,Manuela) 1 梅亚军 1 穆拉斯、拉斐拉 1 穆拉利达兰,奥姆卡尔 1 西扎·阿尔塞纳·穆沙加卢萨 1 丹·奈特尔顿 1 迈克尔·牛顿(Michael A.Newton)。 1 阮宣龙 1 A.詹姆斯·奥马利 1 梅根·奥尔 …还有52位作者 全部的 前5名21篇连载文章中引用 11 美国统计协会杂志 9 应用统计学年鉴 5 遗传学和分子生物学中的统计应用 2 数学生物科学 2 生物计量学 2 应用统计学杂志 2 农业、生物和环境统计杂志 1 统计年鉴 1 Automatica公司 1 生物医学期刊 1 分类杂志 1 统计科学 1 神经网络 1 统计传播。模拟和计算 1 澳大利亚和新西兰统计杂志 1 统计建模 1 马来西亚数学科学学会公报。第二系列 1 统计方法 1 计算与图形统计杂志 1 概率统计杂志 1 贝叶斯分析 全部的 前5名在7个字段中引用 43 统计学(62-XX) 14 生物学和其他自然科学(92-XX) 2 组合数学(05-XX) 2 数值分析(65-XX) 2 计算机科学(68至XX) 2 系统论;控制(93至XX) 1 线性代数和多线性代数;矩阵理论(15-XX) 按年份列出的引文