Phyloseq公司

phyloseq:R软件包,用于微生物群落普查数据的可重复交互式分析和图形。背景:通过DNA测序对微生物群落进行分析带来了许多挑战:将不同类型的数据与生态学、遗传学、系统发育学、多元统计、可视化和测试等方法相结合。随着实验设计越来越广泛,经常需要项目特定的统计分析,而这些分析往往很难(或不可能)由同行研究人员独立复制。进行这些分析的绝大多数必要工具已经在R及其扩展(包)中实现,但对高通量微生物群落普查数据的支持有限。