BaySeq公司

baySeq:计数数据差异表达模式的经验贝叶斯分析。结果:我们提出了一个定义差异表达模式的框架,并开发了一个新的算法bayesq,它使用经验Bayes方法在一组测序样本中检测这些差异表达模式。该方法假定数据为负二项分布,并从整个数据集中导出经验确定的先验分布。我们在实际数据和模拟数据上检验了该方法的性能。


zbMATH参考文献(17篇文章引用)

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按年份排序(引用)

  1. Dadaneh,Siamak Zamani;Qian,Xiaoning;Zhou,Mingyuan:BNP-seq:序列计数数据的贝叶斯非参数差分表达分析(2018)
  2. Yang,Tae Young;Jeong,Seong:通过适应RNA序列长度偏差的程序控制错误发现率(2018)
  3. Zhao,Lili;Wu,Weisheng;Feng,Dai;Jiang,Hui;Nguyen,Xuanlong:使用一系列负二项模型对RNA序列数据进行贝叶斯分析(2018)
  4. Martella,Francesca;Alfò,Marco:个体和多元离散结果联合聚类的有限混合方法(2017)
  5. Park,Jincheol;Lin,Shili:空间染色质结构重建的随机效应模型(2017)
  6. Bonafede,Elisabetta;Picard,Franck;Robin,Stéphane;Viroli,Cinzia:使用混合物对差异表达分析中的过度分散异质性进行建模(2016)
  7. 伊丽莎白约翰逊(Elizabeth Johnson)的二项式离差法(Exotrial Discredition),伊丽莎白·约翰逊(Elizabeth)、珀尔迪(Marruddy)的二项式离差法(Exotrial Discription)和《外项参数》(the differential Discription of the family);伊丽莎白·约翰逊
  8. Cui,Shiqi;Guha,Subharup;Ferreira,Marco A.R.;Tegge,Allison N.:HmmSeq:从RNA序列数据检测差异表达基因的隐马尔可夫模型(2015)
  9. Licio,Andrew;Nettleton,Dan:近交系和杂交基因型RNA序列实验的分层建模和差异表达分析(2015)
  10. Liu,Fangfang;Wang,Chong;Liu,Peng:RNA序列数据差异表达分析的半参数贝叶斯方法(2015)
  11. Nguyen,Yet;Nettleton,Dan;Liu,Haibo;Tuggle,Christopher K.:利用RNA序列数据检测差异表达基因,以解释相关协变量的影响(2015年)
  12. Niemi,Jarad;Mittman,Eric;Landau,Will;Nettleton,Dan:检测基因表达杂种优势的RNA序列数据的经验贝叶斯分析(2015)
  13. Picardi,Ernesto(编辑):RNA生物信息学(2015)
  14. Thorne,Thorne:RNA-seq数据差异表达非参数检测的经验似然检验(2015)
  15. Datta,Somnath(编辑);Nettleton,Dan(编辑):下一代测序数据的统计分析(2014)
  16. Matthias Katzfuss,Andreas Neudecker,Simon Anders,Julien Gagneur:BADER:RNA测序数据中差异表达的贝叶斯分析(2014)阿尔十四
  17. Si,Yaqing;Liu,Peng:应用RNA序列数据控制FDR时的最大平均功率最优检验(2013)