BaySeq公司

baySeq:计数数据差异表达模式的经验贝叶斯分析。结果:我们提出了一个定义差异表达模式的框架,并开发了一个新的算法bayesq,它使用经验Bayes方法在一组测序样本中检测这些差异表达模式。该方法假定数据为负二项分布,并从整个数据集中导出经验确定的先验分布。我们在实际数据和模拟数据上检验了该方法的性能。


zbMATH中的参考文献(参考文献17条)

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按年份排序(引用)

  1. 达达内,锡亚马克·扎马尼;钱小宁;周明远:BNP-seq:序列计数数据的贝叶斯非参数差异表达分析(2018)
  2. 杨泰英;Jeong,Seongmun:通过适应RNA序列长度偏差的程序控制错误发现率(2018)
  3. 赵丽丽;吴伟胜;冯、戴;江,慧;Nguyen,Xuanlong:使用一系列负二项模型对RNA序列数据进行贝叶斯分析(2018)
  4. 玛蒂拉,弗朗西丝卡;阿尔夫ò, 马可:个体和多元离散结果联合聚类的有限混合方法(2017)
  5. 金秋公园;林士力:空间染色质结构重建的随机效应模型(2017)
  6. 伯纳菲,伊丽莎白;皮卡德,弗兰克;罗宾,圣é潘恩;Viroli,Cinzia:使用混合物模拟差异表达分析中的过度分散异质性(2016)
  7. 红润的,肖恩;约翰逊,玛拉;Purdom,Elizabeth:二项族中离散参数的收缩,以及对微分外显子跳过的应用(2016)
  8. 崔世奇;古哈,苏哈鲁普;费雷拉,马可A。R、 。;Tegge,Allison N.:HmmSeq:从RNA序列数据检测差异表达基因的隐马尔可夫模型(2015)
  9. 利西奥,安德鲁;Nettleton,Dan:近交系和杂交基因型RNA序列实验的分层建模和差异表达分析(2015)
  10. 刘芳芳;王冲;刘鹏:RNA序列数据差异表达分析的半参数贝叶斯方法(2015)
  11. 阮,但;内特尔顿,丹;刘海波;Tuggle,Christopher K.:利用RNA序列数据检测差异表达基因,以解释相关协变量的影响(2015年)
  12. 尼米,雅拉德;米特曼,埃里克;兰道,威尔;Nettleton,Dan:检测基因表达杂种优势的RNA序列数据的经验贝叶斯分析(2015)
  13. Picardi,Ernesto(编辑):RNA生物信息学(2015)
  14. Thorne,Thorne:RNA-seq数据差异表达非参数检测的经验似然检验(2015)
  15. 达塔,索姆纳特(编辑);奈特尔顿,丹(编辑):下一代测序数据的统计分析(2014)
  16. Matthias Katzfuss,Andreas Neudecker,Simon Anders,Julien Gagneur:BADER:RNA测序数据中差异表达的贝叶斯分析(2014)阿尔十四
  17. 斯亚青;刘鹏:应用RNA序列数据控制FDR时的最大平均功率最优检验(2013)