Voom公司 swMATH ID: 14009 软件作者: Law,C.W.,Chen,Y.,Shi,W.,Smyth,G.K。 描述: Voom:精确权重解锁用于RNA-seq读取计数的线性模型分析工具。为了分析RNA-seq实验的读取计数,提出了新的正常线性建模策略。voom方法估计对数计数的均值-方差关系,为每个观测值生成精确权重,并将其输入极限经验贝叶斯分析管道。这为RNA-seq分析人员提供了一个为微阵列开发的大量方法体系。仿真研究表明,voom的性能与基于计数的RNA-seq方法相当或更好,即使数据是根据早期方法的假设生成的。两个案例研究说明了线性建模和基因集测试方法的使用。 主页: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4053721/ 相关软件: 边缘R;生物导体;利马;DEseq公司;R(右);DESeq2公司;全球气候变化评估;BaySeq公司;起重机;Phyloseq公司;ggplot2;收缩贝叶斯;顶帽;准序列;卡爪;斯坦;素食主义者;鲑鱼;RSEM(RSEM);RUVseq公司 引用于: 21文件 全部的 前5名63位作者引用 2 丹·奈特尔顿 2 戈登·史密斯(Gordon K。Smyth)。 1 沃伦·亚历山大。 1 伊丽莎白·波纳费德 1 吉勒斯·塞勒克斯 1 程瑞华 1 斯特芬·康威尔 1 赫克托·科拉达·布拉沃 1 梅利娜·加洛平 1 穆罕默德·古纳迪。 1 苏珊·福尔摩斯。 1 胡宗良 1 约瑟夫·乔治·易卜拉欣 1 佛罗伦萨贾夫雷齐克 1 普拉塞帕·杰加纳坦 1 丹尼尔·杰斯克(Daniel R.Jeske)。 1 贾高翔 1 金、冲 1 Johnson,玛拉 1 简·H·金。 1 斯坦利·李 1 李高荣 1 李启伟 1 梁坤 1 安德鲁·利西奥 1 刘芳芳 1 刘海波 1 刘鹏 1 陆伟(Lu,Wei) 1 艾伦·T·L·伦。 1 伊恩·马杰夫斯基。 1 布莱恩·马丁。 1 马丁斯·格林(Martins-Green,Manuela) 1 斯蒂芬·蒙特(Stephen M.Mount)。 1 阮和田 1 贝琳达·菲普森 1 弗兰克·皮卡德 1 伊丽莎白·普多姆 1 安德烈亚·劳 1 罗宾(Stéphane Robin) 1 肖恩·鲁迪 1 米尔科·西尼奥雷利 1 皮埃特罗·斯皮塔利 1 孙骏 1 孙伟 1 唐西明 1 童铁军 1 罗拉·佐纳卡 1 克里斯托弗·图格尔。 1 萨曼莎·范沙尔奎克 1 辛齐亚·维罗利 1 王冲 1 王新雷 1 魏智 1 艾米·威利斯。 1 道格拉斯·威尔逊。 1 伊格纳西奥·维斯塔巴 1 丹妮拉·维滕(Daniela M.Witten)。 1 亚历山大·沃尔夫 1 夏英林 1 谢,杨 1 杨一平 1 周一辉 全部的 前5名9连载 6 应用统计学年鉴 4 农业、生物和环境统计杂志 2 生物计量学 2 遗传学和分子生物学中的统计应用 1 斯堪的纳维亚统计杂志 1 生物医学杂志 1 美国统计协会杂志 1 统计建模 1 ICSA统计丛书 在2个字段中引用 19 统计学(62-XX) 14 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文