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Voom公司

swMATH ID: 14009
软件作者: Law,C.W.,Chen,Y.,Shi,W.,Smyth,G.K。
描述: Voom:精确权重解锁用于RNA-seq读取计数的线性模型分析工具。为了分析RNA-seq实验的读取计数,提出了新的正常线性建模策略。voom方法估计对数计数的均值-方差关系,为每个观测值生成精确权重,并将其输入极限经验贝叶斯分析管道。这为RNA-seq分析人员提供了一个为微阵列开发的大量方法体系。仿真研究表明,voom的性能与基于计数的RNA-seq方法相当或更好,即使数据是根据早期方法的假设生成的。两个案例研究说明了线性建模和基因集测试方法的使用。
主页: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4053721/
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