A群集 swMATH ID: 11002 软件作者: 布伦丹·J·弗雷;德尔伯特·杜克;乌尔里希·博登霍夫(Ulrich Bodenhofer)、约翰·帕尔姆(Johannes Palme)、克拉特斯·梅尔科尼安(Chrats Melkonian)、安德烈亚斯·科特梅尔(Andreas Kothmeier) 描述: 亲和传播(AP)是由Brendan J.Frey和Delbert Dueck引入的一种聚类算法。作者自己将亲和传播描述为:“一种识别数据点之间样本并围绕这些样本形成数据点簇的算法。它的运作方式是同时将所有数据点视为潜在样本,并在数据点之间交换消息,直到出现一组好的样本和集群。”近年来,AP在各个领域都得到了应用,其中生物信息学的重要性日益凸显。弗雷和杜克已经将他们的算法作为Matlab代码提供。然而,Matlab在生物信息学中相对少见。相反,统计计算平台R已成为这一领域广泛接受的标准。为了在生物信息学应用中利用亲和传播,我们将亲和传播实现为R包。然而,请注意,给定的包决不限于生物信息学应用。它与Frey和Dueck的原始Matlab代码一样普遍适用。该软件包进一步实现了杠杆亲和力传播、基于范例的聚合聚类以及各种可视化聚类结果分析工具。 主页: http://www.mloss.org/software/view/264/ 依赖项: Matlab公司 相关软件: ap集群;UCI-毫升;群集查找;R(右);AS 136标准;k平均值++;ElemStatLearn(电子状态学习);剪影;麦克卢斯特;筛选;科恩拉布;PRMLT公司;t-SNE公司;TSPLIB公司;嘲弄;Scikit公司;格拉克勒斯;MNIST公司;MCODE公司;细胞景观 引用于: 101文件 标准条款 1出版物描述软件,包括1出版物以zbMATH为单位 年份 通过在数据点之间传递消息进行聚类。 Zbl 1226.94027号布伦丹·J·弗雷。;德尔伯特·杜克 2007 全部的 前5名294位作者引用 三 Michael J.布鲁斯科。 三 亚历山德罗·法里内利 三 谢赫扎德·哈立德 三 李天瑞 三 王红军 三 徐大川 2 安德鲁奇,劳拉 2 莫森·法托拉(Mohsen Fathollah Bayati) 2 曼纽尔·比塞戈 2 邓萍 2 德尼托,马蒂奥 2 布伦丹·J·弗雷。 2 斯坦·利波维茨基 2 大卫·内贝尔 2 沙希德·拉扎克 2 道格拉斯·斯坦利。 2 安东·弗拉基米洛维奇·乌沙科夫 2 瓦西尔·埃夫,伊戈尔·列奥尼多维奇 2 托马斯·维尔曼 2 吴飞 2 夏、丁寅 2 里卡多·西葫芦 2 张冬梅 2 张英辉 1 桑德拉·阿莱曼尼 1 丹尼尔·阿洛伊斯 1 安森建 1 普拉门·帕尔瓦诺夫·安杰洛夫 1 拉西尔·阿尼鲁德 1 马西耶·安特萨克 1 阿迪尔·巴吉洛夫。 1 皮埃尔·巴尔迪 1 穆罕默德·巴拉吉利。 1 马克·伊曼纽尔·贝勒马尔 1 Raj K.巴特纳加。 1 西蒙·布兰查德。 1 雅切克·Błażewicz 1 安德烈亚·博恩萨克 1 博亚罗夫,A.A。 1 克里斯蒂安·博格斯 1 洛伦佐·波塔雷利 1 阿尔弗雷多·布劳恩斯坦 1 克里斯蒂安·J·布雷特尼德。 1 谢尔卡·布罗迪诺娃 1 雷米·布洛特 1 曹福源 1 卡斯蒂略,奥斯卡 1 卡洛斯·卡斯特罗 1 胡安·卡斯特罗。 1 查伊斯,詹妮弗·图尔 1 拉玛·切拉帕 1 陈伯伦 1 陈玲 1 陈倩倩 1 陈松灿 1 陈业旺 1 陈英霞 1 程东东 1 程瑜 1 LoongFah Cheong 1 彼得·丘纳耶夫 1 福莱钟 1 安德烈·L·V·科埃略。 1 马克·库菲(Marc Comas-Cufí) 1 J.Dennis,克雷迪 1 华盛顿特区斯特拉帕。 1 戴国伟 1 阿明·德哈尼安 1 邓志宏 1 Aniket Anand Deshmukh 1 亚历山德拉·迪·皮耶罗 1 刁英龙 1 罗伯托·迪亚斯·乌拉 1 丁俊迪 1 阿卜杜拉·多拜(Abdullah M.Dobaie)。 1 多安,尤伦 1 杜冬蕾 1 杜涛 1 德尔伯特·杜克 1 劳埃德·T·埃利奥特。 1 艾琳·埃皮法尼奥 1 范一峰 1 方、钱浩 1 方、田 1 安德鲁·弗格森。 1 菲格雷多,Mário A.T。 1 彼得·菲兹莫瑟 1 弗朗西丝卡·福图纳托 1 Gabr,Hend 1 拉赫迪普·加德 1 尼古拉斯·Gálvez Ramírez 1 高军 1 葛、舒飞 1 Givoni,Inmar E。 1 埃尔维·格洛汀 1 龚茂国 1 奥列格·格拉尼钦。 1 顾晓伟 1 郭岳飞 1 芭芭拉·哈默 …还有194多名作者 全部的 前5名55篇连载文章中引用 9 信息科学 9 模式识别 6 国际计算机视觉杂志 5 分类杂志 5 机器学习 5 神经计算 三 欧洲运筹学杂志 2 数学生物科学 2 应用数学建模 2 工程中的数学问题 2 数据挖掘与知识发现 2 浙江大学学报。科学A 2 统计分析与数据挖掘 2 理论生物学杂志 1 倒排索引综述 1 人工智能 1 计算机与数学及其应用 1 数学物理杂志 1 物理报告 1 心理测量学 1 应用数学与计算 1 英国数学与统计心理学杂志 1 计算与应用数学杂志 1 统计科学 1 信息与计算 1 计算机与运筹学 1 亚太运筹学杂志 1 SIAM离散数学杂志 1 SIAM矩阵分析与应用杂志 1 全球优化杂志 1 设计、代码和密码 1 自动化和远程控制 1 计算统计与数据分析 1 数学成像与视觉杂志 1 应用和计算谐波分析 1 数学与人工智能年鉴 1 复杂性 1 软计算 1 组合优化期刊 1 国际应用数学与计算机科学杂志 1 统计建模 1 自然计算 1 计算生物学和化学 1 数据分析和分类进展。ADAC公司 1 医学中的计算和数学方法 1 科学类 1 电子统计杂志 1 算法 1 控制科学与工程杂志 1 概率统计杂志 1 Diskretny®Analiz i Issledovanie Operati® 1 统计与计算 1 计算机科学评论 1 国际系统科学杂志。系统与集成原理与应用 1 Cogent数学 全部的 前5名在14个字段中引用 60 统计学(62-XX) 43 计算机科学(68至XX) 14 运筹学、数学规划(90-XX) 11 生物学和其他自然科学(92-XX) 8 组合数学(05-XX) 6 博弈论、经济学、金融和其他社会和行为科学(91-XX) 三 系统论;控制(93至XX) 三 信息与通信理论、电路(94-XX) 2 概率论与随机过程(60-XX) 2 数值分析(65-XX) 1 欧氏空间的调和分析(42-XX) 1 微分几何(53-XX) 1 量子理论(81-XX) 1 统计力学,物质结构(82-XX) 按年份列出的引文