（IUCr）《结晶学报》第D卷第71卷第3部分，2015年3月

《水晶学报》。(2015).D类71,417-426
doi:10.1107/S1399004714026479

缓冲剂特异性烯醇化酶的结构弓形虫揭示其细胞质和核双重功能

J.阮,T.穆沃,S.H.灯,G.米纳索夫,W.F.安德森,圣托马沃和H.M.Ngó

一种寄生虫蛋白的第二晶体结构优先富集于弓形虫已在2.75求解奥分辨率。缓性子烯醇化酶1在缓性子中作为糖酵解酶和转录调节因子具有不同的功能。

PDB参考:弓形虫烯醇化酶1，3otr

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溶菌酶的结晶(R（右）)-, (S公司)-和(RS系列)-2-甲基-2,4-戊二醇

M.斯塔贝尔,J.雅科西奇,J.伯杰,J.M.卡普,A.阿克塞尔鲍姆,D.萨斯托,S.V.Buldyrev公司,B.J.Hrnjez（英国作家）和N.阿舍里

溶菌酶的结晶(R（右）)-与结晶相比，2-甲基-2,4-戊二醇产生更有序的晶体和更高分辨率的蛋白质结构(S公司)-2-甲基-2,4-戊二醇。结果表明，与手性添加剂的手性相互作用在蛋白质晶体形成中起着重要作用。

PDB参考:溶菌酶，用(RS系列)-2-甲基-2,4-戊二醇，4b4j;用…结晶(R（右）)-2-甲基-2,4-戊二醇，4b4e;用…结晶(S公司)-2-甲基-2,4-戊二醇，4b4i;不含2-甲基-2,4-戊二醇4b49的结晶

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结构性洞察烟曲霉凝集素特异性：AFL结合位点在功能上不等价

J.豪斯,J.科马雷克,G.西奥西,A.瓦罗,A.Imberty公司和M.威默洛娃

The interaction between the烟曲霉对凝集素AFL和生物相关低聚糖进行了检测。将功能数据与蛋白质-糖复合物的详细结构相结合，以了解原子水平上的配体结合。

PDB参考:AFL、apo、4uou;与Lewis Y三糖的复合物，4d4u;与BGA复合，4ah4;αFuc（1-6）GlcNAc，4agt的络合物;复杂的L（左）-加仑，4d52;βMeFuc的络合物，4c1y;与岩藻糖基单糖混合物的复合物，4aha

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五聚体配体门控离子通道GLIC的真正开放形式

Z.Fourati先生,L.索格和M.德拉鲁

GLIC是五聚体配体修饰离子通道（pLGIC）家族中的一个细菌成员，其所有乙酸结合位点都已被定位，其无乙酰结构也已确定。这两个醋酸盐结合位点与其他pLGIC的已知调节变构位点重叠。

PDB参考:GLIC，4季度5;溴乙酸盐配合物，4qh1

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晶格中捕获的催化不同状态：酰氨酰肽酶的底物结合态和清除剂态及其功能意义

D.K.Menyhard,Z.Orgován,Z.Szeltner公司,I.萨莫西和V.哈玛特

寡肽酶具有双重功能的机制包括底物结合和催化活性的解耦。晶体结构A.秘鲁酰氨酰基肽酶-共价抑制剂复合物为底物在该机制中的作用提供了见解。

PDB参考:酰氨酰基肽酶-氯甲基酮抑制剂复合物4re5;4再6

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新型Hsp70s核转运受体Hikeshi的结构和功能分析

J.宋,S.Kose公司,A.渡边,S.-Y.儿子,S.Choi先生,H.Hong（香港）,E.山下,I.Y.公园,N.Imamoto公司和S.J.李

介绍了Hsp70的核转运受体Hikeshi的晶体结构和功能。

PDB参考:Hikeshi，3wvz公司;F97A突变体，3ww0

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的三维结构恶性疟原虫含结合抑制剂的亚精胺合成酶为药物设计提供了新策略

J.斯普伦格,B.斯文森,J.Hálander公司,J.凯里,L.佩尔松和S.Al-Karadaghi公司

在这项工作中，X射线结晶学被用来检测疟原虫精脒合酶的配体复合体恶性疟原虫(功率因数SpdS）。

PDB参考:精脒合酶，与dcAdoMet和4MAN的复合物，4bp3;MTA和腐胺复合物，4bp1;含MTA和4AMA的复合物，4uoe;MTA和精脒复合物，4cxm;与BIPA复合，4cwa

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淀粉样前体蛋白样蛋白1（APLP1）E2结构域与硫酸乙酰肝素的相互作用涉及两种不同的结合模式

S.O.Dahms公司,M.C.迈耶,D.罗瑟,G.穆萨普和M.E.Than先生

介绍了含有和不含有肝素十二糖的APLP1 E2的两种X射线结构，揭示了该蛋白与硫酸乙酰肝素的两种不同结合模式。这些数据为APP-like蛋白如何与硫酸乙酰肝素结合以及它们如何特异性识别硫酸乙酰肝烷的非还原结构提供了一种机制性解释。

PDB参考:载脂蛋白APLP1 E2，4rd9;APLP1 E2与dp12，4rda复合体

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砷的二硫键级联机制（III）S公司-腺苷硫堇甲基转移酶

K.马拉帕卡拉,C.帕基亚纳坦,A.A.阿吉斯,D.S.Dheeman先生,B.桑卡拉,P.坎达维鲁和B.P.罗森

砷的四个保守半胱氨酸残基中的两个（III）S公司-腺苷甲硫氨酸甲基转移酶结合芳香族砷。另外两个保守的半胱氨酸残基形成二硫键。

PDB参考:CmArsM，含结合苯亚砷酸盐，4kw7;结合洛克沙松，4rsr

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GTP激活SAMHD1的底物控制变构调控机制

C.-F.朱,魏伟（W.Wei）,X.彭,Y.-H.Dong先生,Y.龚和X.-F.于

结合GTP的SAMHD1二聚体和结合GTP/dNTP的SAVHD1四聚体的晶体结构阐明了GTP激活SAMHD1的底物控制变构调节机制。

PDB参考:SAMHD1，与GTP复合，4rxo;含GTP和dATP的复合物，4rxp;带有GTP和dUTP的复合体，4rxq;与GTP和dCTP复合，4rxr;GTP和dTTP复合物，4rxs

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1.65 AZD4547与FGFR1激酶结构域复合物的光学分辨结构显示出精细的分子识别

Y.Yosaatmadja先生,A.V.帕特森,J.B.斯迈尔和C.J.乡绅

AZD4547与FGFR1激酶结构域之间的复合物在配体和蛋白质之间显示出精细的分子识别，通过P环的闭合形成一个扩展的空腔。

PDB参考:FGFR1与AZD4547，4wun复合体

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智能材料在蛋白质结晶中的自动化应用

S.Khurshid公司,L.戈瓦达,谢里夫,S.M.雷迪和N.E.Chayen公司

描述了用于自动化蛋白质结晶试验的第一种半液体非蛋白成核剂。这种“智能材料”被证明可以诱导晶体生长，并将为学术界和工业界的科学家提供一种简单、成本效益高的工具。

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中度嗜盐菌高酸性β-内酰胺酶的结构色盐杆菌属sp.560和Cs的发现⁺-选择性结合位点

S.Arai公司,Y.Yonezawa先生,N.冈崎,F.松本,C.柴崎,清水R.Shimizu,山田先生,M.阿达奇,T.塔马达,川本茂先生,H.托库纳加,石桥先生,M.Blaber先生,M.Tokunaga先生和R.Kuroki先生

盐杆菌β-内酰胺酶的三级结构色盐杆菌属sp.560（HaBLA）通过X射线晶体学测定。三个独特的Sr²⁺-结合位点和一个Cs⁺-在HaBLA分子中发现了结合位点。

PDB参考:β-内酰胺酶，野生型，3wrt;N288Q/N321Q突变体，3wrz;第0周;3周1;3周2;3工作日4;3工作日5

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含有和不含配体的人Pals1 PDZ结构域的结构表明Crb通过门控通路进入PDZ肽结合沟

M.E.伊万诺娃,G.C.弗莱彻,N.O'Reilly公司,A.G.珀基斯,B.J.汤普森和N.Q.麦当劳

本研究描述了基本极性蛋白Crb的羧基末端（ERLI）基序与Pals1/Stardust PDZ域蛋白之间的相互作用。描述了含有和不含Crb肽的人Pals1 PDZ的结构，解释了ERLI基序的高度保守性质，并揭示了在没有配体的情况下，空间位阻的肽结合沟。

PDB参考:PDZ–肽复合物，4uu5;无配体PDZ结构域，4uu6

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三个多囊肾病样结构域的结构溶组织梭菌胶原酶ColG和ColH

R.鲍尔,K.Janowska公司,K.泰勒,B.约旦,S.Gann公司,T.贾诺夫斯基,E.C.拉蒂默,O.松下和J.萨肯

ColG和ColH的PKD-like畴的表面性质和动力学不同。

PDB参考:ColG PKD域2，4jrw;4吨9;ColH PKD域2a，apo，4u6t;在有钙的情况下，4u7k;ColH-PKD结构域2b，存在钙时，4jgu

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人NKR-P1配体LLT1在不同糖基化和齐聚状态下的四种晶体结构

T.斯卡洛娃,J·巴拉哈,K.Harlos公司,J.杜什科娃,T.科瓦尔,J.斯特兰斯克,J.哈舍克,O.Vaněk和J.多赫内克

报道了人NKR-P1配体LLT1的四种晶体结构。

PDB参考:人LLT1，二聚体形式，4qkh;4qki公司;六元形式，4qkj;单体形式，4qkg

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涉及多个LysM结构域的分子间结合机制通过内肽酶介导碳水化合物识别

J.E.M.M.Wong先生,S.R.Midtgaard公司,K.Gysel公司,M.B.蒂格森,K·K·Sörensen,K.J.詹森,J.斯托加德,S.Thirup公司和M.布莱斯

晶体和溶液结构嗜热杆菌NlpC/P60D类,L（左）-内肽酶及其与甲壳己糖结合的N末端LysM结构域的共晶体结构允许提出关于该酶如何识别肽聚糖的建议。

PDB参考:第60页，4xcm;P60_2LysM，4uz2型;P60_2LysM与壳聚糖结合，4uz3

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自动化从头开始线圈蛋白的定相和模型建立

S.Rämisch公司,R.Lizatović和I.安德烈

提出了一种全自动的程序，该程序基于以下模型为线圈结构寻找分子置换解决方案从头开始结构预测。

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钙激肽的X射线、光谱和正常模式动力学：神经元钙信号蛋白的结构-功能研究

P.T.厄斯金,A.福克斯,C.穆里提斯,H.雷赫曼,洛杉矶·耶茨,A.鲍耶,I.S.芬德洛,R.哈根,J.M.沃纳,A.J.迈尔斯,B.A.华莱士,S.A.Wells公司,S.P.木材和J.B.库珀

引入了模拟神经元钙信号蛋白钙激活素磷酸化的Thr-Asp突变，并测定了相应的晶体结构，表明C末端磷酸化位点（Thr188）对分子构象的影响最大。核磁共振和正常模式动力学表明，野生型蛋白质在溶液中的构象比晶体学研究先前指出的更开放，进一步的突变工作表明，蛋白质C末端结构域中的单一钙结合位点可能具有感官作用。

PDB参考:钙激肽，T188D突变体，4ndc;T61D+T188D双突变体，第4天;T61D突变体，4ndb

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