结晶学报D辑
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生物学的
结晶学
第55卷
|
第6部分
国际标准编号:1399-0047
1999年6月发行
封面插图:
热椭球表示,由生成
光栅3D
霍乱毒素B五聚体结构的原子各向异性在1.25º下精制(p.1109)。
专题评论
《水晶学报》。
(1999).
D类
55
,
1109-1117
doi:10.1107/S090744999003789
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扩展模型:蛋白质结构细化中的各向异性位移参数
E.A.Merritt公司
提出将原子各向异性分布作为用单个各向异性位移参数细化蛋白质结构的验证工具
U型
ij公司
对蛋白质数据库中当前所有此类蛋白质模型的分布进行了检查。
阅读文章
研究论文
《水晶学报》。
(1999).
D类
55
,
1118-1126年
doi:10.1107/S090744999002322
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无生物素Tyr43Phe链霉亲和素的原子分辨结构:结合位点中有什么?
S.弗赖塔格
,
一、乐荣
,
L.A.Klumb公司
,
P.S.斯塔顿
和
R.E.斯坦坎普
链霉亲和素Y43F突变体的原子分辨率精细化显示,2-甲基-2,4-戊二醇分子位于生物素结合位点。
PDB参考
:
Y43F链霉亲和素突变体,1swu
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《水晶学报》。
(1999).
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55
,
1127-1135年
doi:10.1107/S090744999002528
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牛视网膜核苷二磷酸激酶两种亚型的三维结构
J.E.拉德纳
,
N.G.阿卜杜拉耶夫
,
D.L.卡库耶夫
,
M.Tordová
,
K.D.山脊
和
G.L.吉利兰
牛视网膜中核苷二磷酸激酶的两种亚型的晶体结构被报道为2.4
奥分辨率。
PDB参考
:
丁腈橡胶-A,1bhn
;
NBR-B,1be4
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《水晶学报》。
(1999).
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55
,
1136-1143
doi:10.1107/S090744999003182
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不对称单元中具有两个独立双工的A-DNA结构
G.萨维塔
和
维斯瓦米特拉硕士
晶体结构包含两个d(G)的A-DNA十聚体双工体
4
CGC公司
4
)在不对称单元中。
这两个分子之间的结构差异似乎源于序列的内在倾向,即不同的分子间相互作用和延展性。
NDB参考
:
d(G
4
CGC公司
4
),ad0002
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《水晶学报》。
(1999).
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55
,
1144-1151
doi:10.1107/S090744999003297
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2.55β-莫莫肝素的三维结构
奥数分辨率
Y.-R.元
,
Y.-N.何
,
熊建平(J.-P.Xiong)
和
Z.-X.夏
β-莫莫肝素的二级和三级结构类似于其他单链核糖体激活蛋白(RIPs)。
低聚糖通过N-糖苷键与蛋白质相连,从远离活性位点的分子表面延伸,并通过氢键与蛋白质相互作用,其中大多数是与相邻单元细胞中的蛋白质原子的分子间相互作用。
PDB参考
:
β-莫诺肝素,1cf5
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《水晶学报》。
(1999).
D类
55
,
1152-1157
doi:10.1010/S0907444999003807
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马脱乳铁蛋白的结构:N和C叶呈闭合形式
A.K.夏尔马
,
K.R.Rajashankar公司
,
M.P.Yadav先生
和
T.P.辛格
马脱乳铁蛋白的结构表明,N和C叶均采用闭合构象。
因此,母马脱乳铁蛋白的结构不同于人脱乳铁素和鸭脱乳铁蛋白的结构。
PDB参考
:
母马脱乳铁蛋白,1b7u
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《水晶学报》。
(1999).
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55
,
1158-1167
doi:10.1107/S090744999003972
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1.7
稳定REI的结构
v(v)
突变体T39K。
局部NCS约束的应用
I.乌森
,
E.波尔
,
T.R.施耐德
,
Z.道特
,
A.施密特
,
H.J.弗里茨
和
G.M.谢尔德里克
SHELX公司
对免疫球蛋白片段的中分辨率精细化策略进行了说明。
测试了局部NCS约束、各向异性缩放和各向异性细化的影响,并计算了标准不确定度。
PDB参考
:
REL公司
v(v)
-T39K,1bww型
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《水晶学报》。
(1999).
D类
55
,
1168-1173
doi:10.1107/S090744999003698
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将MAD发挥到极致:超快速蛋白质结构测定
M.A.沃尔什
,
I.德蒙蒂耶娃
,
G.埃文斯
,
R.萨尼什维利
和
A.约阿希姆亚克
在45年内完成了一项多波长反常衍射实验
min,使用结构生物学中心位于高级光子源的19ID波动光束线的同步辐射。
PDB参考
:
伴侣蛋白顶端结构域,1srv
阅读文章
《水晶学报》。
(1999).
D类
55
,
1174-1178
doi:10.1107/S090744999003583
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打开
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σ
2
R(右)
,大分子电子密度图质量的倒数空间度量
T.C.特威利格
提出了一种基于图谱局部粗糙度方差的高分子晶相质量的倒数空间度量方法。
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(1999).
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55
,
1179-1187
doi:10.1107/S090744999004758
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孪生的检测和治疗:改进和新结果
P.杜马
,
E.恩尼法尔
和
P.沃尔特
提出了一种用于检测孪生的统计检验方法的改进,一种确定孪生水平的新方法,以及一种新的孪生参数化方法。
阅读文章
《水晶学报》。
(1999).
D类
55
,
1188-1192
doi:10.1107/S090744999004400
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T7 RNA聚合酶的低盐结晶:实现转录气泡复合物的第一步
C.J.陈
,
Z.J.刘
,
J.P.罗斯
和
B.-C.王
为T7 RNA聚合酶获得了新的低盐结晶条件,并已用于生成天然酶晶体、嵌合T7/T3 RNA聚合物和含有N末端组氨酸标记的天然T7 RNA聚合物。
阅读文章
结晶纸
《水晶学报》。
(1999).
D类
55
,
1193-1197
doi:10.1107/S090744998014024
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凝血酶样酶急性血栓形成素-B的纯化、表征、结晶和初步X射线衍射
尖吻蝮蛇
毒液
S.刘
,
Q.黄
,
十、朱
,
M.滕
和
L.Niu(牛)
急性凝血酶原B(一种凝血酶样酶,由两条不相同的多肽链(14.4和16)组成)的晶体
kDa)来自
锐角类
毒液,混入太空群
P(P)
2
1
分辨率极限接近2
?和单位-细胞参数
一
= 34.97,
b条
= 53.58,
c(c)
=67.88
?,β=98.89°,每个不对称单元包含一个分子。
阅读文章
《水晶学报》。
(1999).
D类
55
,
1198-1200人
doi:10.1107/S090744999001638
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CD55生物活性片段的结晶和初步X射线衍射分析
S.Lea公司
,
R.鲍威尔
和
D.埃文斯
晶体由CD55病毒结合结构生长而成,其X射线衍射至少为1.65
Å。
阅读文章
《水晶学报》。
(1999).
D类
55
,
1201-1203
doi:10.1107/S090744999003595
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提纯、结晶和初步X射线分析
黑腹果蝇
铁螯合酶
K.-F.王
,
C.-K.Wu先生
,
V.M.卖方
,
J.P.罗斯
,
B.-C.王
和
H.A.Dailey先生
铁螯合酶
D.黑腹果蝇
已被纯化并结晶成完整的[2Fe–25]簇。
晶体衍射到3.0
空间组为
我
422
阅读文章
《水晶学报》。
(1999).
D类
55
,
1204-1205
doi:10.1010/S0907444999003571
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大豆种子碱性凝集素的结晶和初步X射线研究
多毛阿托卡巴
K.N.Rao先生
,
M.M.Gurjar先生
,
S.M.盖克瓦德
,
M.I.汗
和
C.G.苏雷什
碱性凝集素的两种正交晶型和一种六方晶型的初步X射线表征
A.多毛
已报告。
阅读文章
《水晶学报》。
(1999).
D类
55
,
1206-1208
doi:10.1107/S090744999003601
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双功能酶甲酸转移酶-环脱氨酶的甲酸转移酶结构域的结晶和初步X射线分析
D.科尔
,
N.克罗托
,
N.Mejia公司
,
R.E.麦肯齐
和
A.Vrielink公司
参与叶酸代谢的双功能通道酶甲酸转移酶环脱氨酶的甲酸转移酶结构域已在空间群中结晶
P(P)
2
1
2
1
2
1
自然衍射数据和汞衍生物的数据已收集到2.8
奥分辨率。
阅读文章
《水晶学报》。
(1999年)。
D类
55
,
1209-1211
doi:10.1107/S090744999003716
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细胞色素P450的结晶及初步X射线衍射分析
sca-2型
从
嗜碳链霉菌
参与生产HMG-CoA还原酶组织选择性抑制剂普伐他汀钠
S.伊藤
,
T.松冈
,
一、渡边
,
T.川崎
,
N.Serizawa公司
和
T.哈塔
细胞色素P450
sca-2型
从
嗜碳链球菌
已使用硫酸铵作为沉淀剂结晶。
晶体衍射到2.2
奥分辨率。
阅读文章
《水晶学报》。
(1999).
D类
55
,
1212-1214
doi:10.1010/S0907444999003790
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6-磷酸-α-葡萄糖苷酶的结晶和初步X射线分析
枯草芽孢杆菌
A.瓦罗
,
H.山本
,
J.Sekiguchi先生
,
J.汤普森
和
G.J.戴维斯
GlvA晶体,6-磷酸-α-葡萄糖苷酶
枯草杆菌
,以适合X射线衍射研究的形式生长。
阅读文章
《水晶学报》。
(1999).
D类
55
,
1215-1218
doi:10.1010/S0907444999004047
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血氧传感器FixL传感器区域的动态光散射和初步晶体学研究
草木犀根瘤菌
H.宫崎骏
,
M.卡奈
,
S.阿达奇
,
H.中村
,
K.Tamura(田村)
,
H.塔尼达
,
Tsuchiya先生
,
伊祖卡(T.Iizuka)
和
Y.Shiro先生
一种新的氧传感器结构域纯化方法
梅利洛蒂河
报道了其溶液的动态光散射研究和初步晶体学数据。
阅读文章
《水晶学报》。
(1999).
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55
,
1219-1221
doi:10.1107/S090744999004059
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结晶和初步X射线分析
酿酒酵母
磷脂酶信号转导的关键中间体Ypd1p
M.G.Lee先生
,
J.Y.Lee先生
,
香港宋
和
S.W.Suh先生
重组
酿酒酵母
Ypd1p与His融合
6
-其C末端的标签已经结晶。
三斜晶在不对称单元中含有四个单体Ypd1p,本征数据已收集到2.3
Å。
阅读文章
《水晶学报》。
(1999).
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55
,
1222-1225
doi:10.1107/S090744999004114
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周质四aem黄细胞色素的结晶和初步X射线晶体学分析
c(c)
3
从
冷夏瓦氏菌
具有富马酸还原酶活性的NCIMB400
V.班福德
,
P.S.多宾
,
S.李
,
A.雷利
,
A.K.鲍威尔
,
D.J.理查森
和
A.M.海明斯
周质四氢黄细胞色素
c(c)
3
从
冰毒沙门菌
具有富马酸还原酶活性的NCIMB400已经结晶。
晶体属于空间群
P(P)
2
1
2
1
2
1
带有单元-单元参数
一
= 72.4,
b条
= 110.1,
c(c)
= 230.2
Å.
假设不对称单元中有一个分子二聚体,晶体中含有65%的溶剂,当冷冻到100
K、 衍射至少3.0
奥分辨率。
测量了铁的X射线吸收边缘,为MAD定相实验做准备。
阅读文章
《水晶学报》。
(1999).
D类
55
,
1226-1228
doi:10.1107/S090744999004394
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磷酸泛乙烯腺苷酸转移酶的立方晶体
大肠杆菌
T.伊扎德
,
A.吉尔洛夫
,
A.勒文登
和
J.J.巴克
重组磷酸泛乙烯腺苷酸转移酶是辅酶a(CoA)生物合成的关键晚期酶
大肠杆菌
已与各种底物、其抑制剂(CoA)和载脂蛋白形式形成络合物结晶。
阅读文章
《水晶学报》。
(1999).
D类
55
,
1229-1230
doi:10.1107/S090744999004576
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D-49磷脂酶a吡拉毒素III的结晶和初步X射线衍射研究
2
从…的毒液中
皮拉杰肉毒杆菌
L.Wen-Hwa先生
,
M.H.富山
,
A.M.苏亚雷斯
,
J.R.吉利奥
,
S.Marangoni公司
和
一、波利卡波夫
Piratoxin III,一种D-49磷脂酶a
2
从
B.皮拉杰
在单斜空间群中结晶
C类
2,其结构已通过2.7的分子置换得到解决
Å。
阅读文章
《水晶学报》。
(1999).
D类
55
,
1231-1233
doi:10.1010/S090744499900459X
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卤代烷脱卤酶LinB的结晶及初步X射线衍射分析
少动鞘氨醇单胞菌
UT26型
I.斯马塔诺娃
,
Y.Nagata(永田)
,
L.A.Svensson公司
,
高木先生
和
J.马雷克
水解卤代烷脱卤酶
少运动链球菌
UT26采用PEG 6000作为沉淀剂,通过蒸汽扩散法结晶。
原始衍射数据收集到1.6
低温条件下的分辨率。
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《水晶学报》。
(1999).
D类
55
,
1234-1236
doi:10.1107/S09074499900476X
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提纯、结晶和初步X射线晶体学研究
酿酒酵母
Hsp40 Sis1
B.沙
和
D.赛尔
酿酒酵母
Hsp40 Sis1已被纯化并结晶。
晶体衍射到2.7
和属于空间组
P(P)
4
1
2
1
2或
P(P)
4
3
2
1
2
阅读文章
《水晶学报》。
(1999).
D类
55
,
1237-1239
doi:10.1107/S090744999004771
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一种蛋白酶抗性肉毒杆菌神经毒素相关蛋白Hn-33的初步晶体学研究
A.T.哈德菲尔德
,
G.佩茨科
,
P.林多
和
B.-R.辛格
Hn-33是a型肉毒杆菌神经毒素毒性复合物中的一种蛋白质,已使用蒸汽扩散技术结晶。
晶体属于正交空间群,衍射分辨率为2.6
Å。
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《水晶学报》。
(1999).
D类
55
,
1240-1241
doi:10.1107/S090744999004783
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磷脂酶a天然复合物的纯化、结晶及初步晶体学分析
2
从
埃希斯·卡里纳图斯
(锯鳞蝰蛇)
A.纳格帕
,
V.钱德拉
,
P.Kaur先生
和
T.P.辛格
一种新型磷脂酶A复合物
2
已从锯鳞蝰蛇中分离纯化出与另一种毒液蛋白复合的毒液蛋白(
锯鳞蝰
)毒液。
用7%结晶(
w个
/
v(v)
)聚乙二醇
4000,晶体属于单斜空间群
P(P)
2
1
带有单元-单元参数
一
= 74.47,
b条
= 47.87,
c(c)
= 106.19
Å。
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《水晶学报》。
(1999).
D类
55
,
1242-1243
doi:10.1107/S090744999005430
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兔肝脏金属硫蛋白II的结晶及初步X射线研究
Y.安
,
G.李
和
B.鲁
镉诱导的兔肝脏金属硫蛋白II在空间群中结晶
P(P)
6
2
22或
P(P)
6
4
22.已获得柠檬酸钠和Tris–HCl缓冲液结晶的单元-细胞参数。
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《水晶学报》。
(1999年)。
D类
55
,
1244-1246
doi:10.1107/S090744999005065
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大麦Bowman–Birk胰蛋白酶抑制剂与猪胰蛋白酶复合物的结晶和初步X射线分析
Y.S.Kim先生
,
香港宋
和
S.W.Suh先生
来自大麦种子的Bowman–Birk胰蛋白酶抑制剂与猪胰蛋白酶之间的1:2复合物已结晶。
原始X射线衍射数据已收集到2.2
Å。
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《水晶学报》。
(1999).
D类
55
,
1247-1249
doi:10.1010/S0907444999003364
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超吸水分形表面在高分子结晶中的应用
一、富士
和
N.平山
分形表面在采用坐滴气相扩散法进行大分子结晶中是有效且有前景的。
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